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TATGATAGCTTTGAGTTCGGGAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGANCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTG < 1:152217/300‑1 TAGCTTTGAGTTCGGGAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCC < 1:341095/300‑1 TTGAGTTCGGTAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGT < 1:168012/300‑1 TTGAGTTCGGGAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGT < 1:671436/300‑1 TGAGTTCGGGAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTG < 2:378520/300‑1 TGAGTTCGGGAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGT < 1:671431/299‑1 GAGGTAGTGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCAAGCCTTGCAAGATGTTGTCTAAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTNGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGAAGCTCAAGTGTGGACAGAGTGCGTTCACCGAA > 2:209228/1‑299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2170380‑2170171‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTTCACCGAA < NC_000913/4519239‑4518943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |