| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 820,914 | IS5 (+) +4 bp | coding (122‑125/714 nt) | ybhM → | Bax1‑I family protein YbhM |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 94 (1.100) | 66/590 | 0.1 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 820914 = | 0 (0.000) | coding (122/714 nt) | ybhM | Bax1‑I family protein YbhM | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 97 (1.140) | 61/588 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 820917 | 0 (0.000) | coding (125/714 nt) | ybhM | Bax1‑I family protein YbhM | |||||
CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274862‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCCTCGTGCTGAAAATCTAATTTATTGCTGTTTTGCGAGTATGATTCCATTCTTTTAGTTATCCTTAGAAAAAATATTAATATTCACCATCAATAAATTTAAAACCACGCATACAAAATACTTTTGCATTTATGGATACAGAAAACGCTTCCGCTCGTCC‑ATAAGGCATATTTTATACCTGGTACTTGTTAAGTGTCGTTTTTAGTAAGAAAAAAATCCCGAC < NC_000913/820917‑820620 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCA > 1:630908/1‑299CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCATTAGCTCCC > 2:176298/1‑297 TCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT < 1:19552/300‑1 GGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCNGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGT > 2:494390/1‑300 GGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGT > 1:657974/1‑300 tgGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC < 2:567817/298‑1 TTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTTTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC < 1:347272/300‑1 TTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCATGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC < 1:347263/300‑1 TTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC < 1:347248/300‑1 GTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTAACAGCATTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑T > 1:566033/1‑299 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GTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCCTGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCCTGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCCGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTA > 1:645148/1‑300 GTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATATGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTA > 2:380175/1‑300 ATGCTTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCCctgtctcttatacacatctcgcag < 1:528651/300‑25 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GG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCTGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCC < 2:584949/300‑1 G‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCCT < 1:93288/300‑1 gcaATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCACACCTTCCTTAGCTCACCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCATCTAATATCC > 2:614097/4‑294 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TTCCCTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCCTCGTGCTGAAAATCTAATTTATTGCTGTTTTGCGAGTATGATTCCATTCTTTTAGTTATCCTTAGAAAAAATATTAATCTTCACCATCAATAAATTTAAAACCACGCATACAAAATACTTTTGCATTTATGGATACAGAAAACGCTTCCGCTCGTCC‑ATAAGGCATATTT > 1:620204/1‑252 CCTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCCTCGTGCTGAAAATCTAATTTATTGCTGTTTTGCGAGTATGATTCCATTCTTTTAGTTATCCTTAGAAAAAATATTAATATTCACCATCAATAAATTTAAAACCACGCATACAAAATACTTTTGCATTTATGGATACAGCAAACGCTTCCGCTCGTCC‑ATAAGGCATATTTTATACCTGGTACTTGTTAAGTGTCGTTTTTAGTAAGAAAAAAATCCC > 2:402759/1‑297 CCTTAGCTCCCAAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCCTCGTGCTGAAAATCTAATTTATTGCTGTTTTGCGAGTATGATTCCATTCTTTTAGTTATCCTTAGAAAAAATATTAATATTCACCATCAATAAATTTAAAACCACGCATACAAAATACTTTTGCATTTATGGATACAGAAAACGCTTACGCTCGTCC‑ATAAGGCATATTTTATACCTGGTACTTGTTAAGTGTCGTTTTTAGCAAAAAAAAAATCCCGAC > 2:8762/1‑300 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGG‑‑CCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCT‑GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274862‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGCTCCCCAGGCT‑‑AGTCC‑‑TGCGGTTGCCACCAAA‑‑CCTAAAGCGGTAATGAGCCATATACCGTTTAATATCCTGGCCTCGTGCTGAAAATCTAATTTATTGCTGTTTTGCGAGTATGATTCCATTCTTTTAGTTATCCTTAGAAAAAATATTAATATTCACCATCAATAAATTTAAAACCACGCATACAAAATACTTTTGCATTTATGGATACAGAAAACGCTTCCGCTCGTCC‑ATAAGGCATATTTTATACCTGGTACTTGTTAAGTGTCGTTTTTAGTAAGAAAAAAATCCCGAC < NC_000913/820917‑820620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |