| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696466 | 80 (1.030) | 7 (0.090) | 7/570 | 5.7 | 9.1% | noncoding (39/75 nt) | glnX | tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 696902 = | 62 (0.820) | noncoding (38/75 nt) | glnU | tRNA‑Gln | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAATTTCGCCACTCCCGCAAAAAAAGATGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATCTTTTTTTTCGCGATACCTTATCGGCGTTGCGGGGCGCATTATGCGTATAGAGCCTTGCAG > NC_000913/696616‑697196 | aacaaacttcttttGAATTGTCCGAACATATTCGATACATTCAGATTTTGGTGGCTACGGCGGGATTCGAACCGGCGGCCCCATCAGTATGAGCGATATGCTTCAACTAAATAAGCGACGTAGCCAGAGTGTTTTTACGATGGCTGGGGTACTGGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTGACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCgg < 2:413607/289‑1 (MQ=25)aacaaATTTTTTTTGAATTTTCCTAACATATTCGATACATTCAGAATTGGGGGGCTACGACGGGAGTCGAACCTGTGGCCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTAAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTGCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCgg < 2:89087/299‑1 (MQ=38) aaTTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATGTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGACAGATTGTTTCTGCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCt < 2:110119/300‑1 (MQ=255) aaTTGGTTGTAAATTTGACTAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGGGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCGACTGAGCTACGTGGCCAGATTGTTTCTGCGATGGCTGGGGTACTTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGTTATCAAAAACCGGTGCCCTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTGCTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCt < 2:111122/300‑1 (MQ=38) 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AACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAATTTCGCCACTCCCGCAAAAAAAGATGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATCTTTTTTTTCGCGATACCTTATCGGCGTTGCGGGGCGCATTATGCGTATAGAGCCTTGCAG > NC_000913/696616‑697196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |