| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4079197 | 126 (1.620) | 5 (0.070) | 5/546 | 6.4 | 4.4% | intergenic (+759/‑94) | fabY/yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
| ? | NC_000913 | 4079636 = | 103 (1.430) | intergenic (+127/‑115) | yiiE/yiiF | putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE/protein YiiF | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTCGCACATACATTAATGAGTAATATATGTAAGGTATTGGTAATGGCGATGAATACGGTTTTTCTTCATTTATCAGAAGAGGCAATTAAACGGCTGAACAAGCTTCGGGGCTGGCGTAAGGTTTCACGATCTGCAATTTTACGCGAAGCGGTAGAGCAATATCTGGAACGTCAGCAATTCCCGGTGCGTAAAGCAAAGGGAGGCAGGCAAAAGGGGGAGGTAGTTGGTGTTGATGATCAGTGTAAGGA > NC_000913/4078907‑4079496 | aacaacTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAaacaac < 2:318652/300‑1 (MQ=255)aacaacTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTAAACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATCCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAAAACTCTTCTTACTTCTGGAAAACACATAGCAAAAACAAaccaac > 2:142165/1‑300 (MQ=255)aacaacTTTCCCGAACTGTTAACAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGATGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCAACTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTATGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGCAGACGCCTCGCAgagacaaaa > 2:142257/1‑296 (MQ=255) gTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCttt > 1:33745/1‑300 (MQ=255) caacaaAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCAGCTTTTTTTa > 1:614058/1‑300 (MQ=255) aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATNATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTc > 2:443570/1‑300 (MQ=255) aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATACATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTAGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTc > 2:173378/1‑300 (MQ=255) aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTNTTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTc > 1:118590/1‑300 (MQ=255) aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTNTTTCTGGAAAACGCCTAGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTc > 1:118078/1‑300 (MQ=255) aGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTc > 1:106425/1‑300 (MQ=255) 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AACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACCGGTCTGTGATGAAAGATTAATTTCACCTTAAATCCTGGTGCTGTTAGGATGCTGACGTTTTTCGGCTACACCATTCAGATTATGCAAATAAATATCTCTGAATATAATATATTCATAGCACCCATAATTCATCCTGGGCGATAACTAAACCATTTTTGAGTAATAAATGAAACAACTGCAACACTCTTATTATTTCTGGAAAACGCCTCGCAAAAACAAAACAACATGCAAAAATCCGCTTTTTTTAAATGATTTTCCGGCGTAATTTTCGCACATACATTAATGAGTAATATATGTAAGGTATTGGTAATGGCGATGAATACGGTTTTTCTTCATTTATCAGAAGAGGCAATTAAACGGCTGAACAAGCTTCGGGGCTGGCGTAAGGTTTCACGATCTGCAATTTTACGCGAAGCGGTAGAGCAATATCTGGAACGTCAGCAATTCCCGGTGCGTAAAGCAAAGGGAGGCAGGCAAAAGGGGGAGGTAGTTGGTGTTGATGATCAGTGTAAGGA > NC_000913/4078907‑4079496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |