| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,938,983 | IS2 (–) +5 bp | coding (757‑761/993 nt) | rbsR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3938983 = | 0 (0.000) | 84 (1.080) | 58/590 | 0.1 | 100% | coding (757/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3938987 | 0 (0.000) | 81 (1.040) | 50/590 | 0.3 | 100% | coding (761/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
ATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGATCAAATTATTACCATCGGTTGTTTTCAGAAGCATGAACATTGC > NC_000913/3938690‑3939280 | aTCTTATTCCGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGGCTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCATTTAt > 2:39679‑M1/1‑298 (MQ=255)aTCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAt > 2:39837‑M1/1‑298 (MQ=255)aTCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAt > 1:54350‑M1/1‑298 (MQ=255) ggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTatat > 1:110431‑M1/281‑298 (MQ=255) aCTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGTAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatat < 2:533675‑M1/300‑18 (MQ=255) ggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGc > 1:300703‑M1/278‑300 (MQ=255) tagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgngatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTatat > 2:189001‑M1/270‑287 (MQ=255) gtaagacttccttcctggtattgcttacgccatagaaataacttgcttgctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaattgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCATGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAg > 2:116852‑M1/268‑300 (MQ=255) ggCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatc > 1:180481‑M1/1‑272 (MQ=255) agacttccttcctgttattgcttacgccatagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaactagggagaccgtcatccccggttcaaagctcttctgaacaattgcgatcctttcctgtgtggtacgccgtctgcggttctccggccctaanacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtatggagactatcacttatttaagtgatgttggttgtctggagattcagggtggcagtctaGTTTACCAGGCGTTATAGCAGGCAGAGGTACAg > 2:437781‑M1/265‑297 (MQ=255) 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tAGCAACGCAATATCTGATCCATAAAGGTCATACCTTTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCTGCGCGCCTGCGGTTTGAAGGTTATCGGGCTGCAATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 2:103913‑M1/300‑39 (MQ=255) ttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAg > 1:75781‑M1/257‑298 (MQ=255) aaCGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCTCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGNAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 2:470317‑M1/296‑39 (MQ=255) 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aTCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggac < 1:359416‑M1/299‑242 (MQ=255) tCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggacttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggac < 2:350849‑M1/298‑242 (MQ=255) tGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcac < 1:503526‑M1/300‑249 (MQ=255) gTCCTCAGGCCTTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgc < 2:372475‑M1/300‑252 (MQ=255) gTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgc < 1:503568‑M1/300‑252 (MQ=255) gctattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGATCAAattat < 1:567037‑M1/264‑1 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAAACGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGATCAAattat < 1:340570‑M1/264‑1 (MQ=255) gCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatc < 1:471230‑M1/299‑280 (MQ=255) agtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGATCAAATTATTACCATCGGTTGTTTTCAGAAGCATGAAc > 1:317948‑M1/7‑299 (MQ=255) | ATCTTATTCAGGATAACTCGTTGCTGGGCGGAGACTTAGCAACGCAATATCTGATCGATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGATCAAATTATTACCATCGGTTGTTTTCAGAAGCATGAACATTGC > NC_000913/3938690‑3939280 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |