| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1950744 | 93 (1.190) | 3 (0.040) | 3/566 | 7.7 | 3.4% | intergenic (‑222/‑88) | aspS/yecD | aspartate‑‑tRNA ligase/isochorismatase family protein YecD |
| ? | NC_000913 | 1951075 = | 81 (1.080) | coding (244/567 nt) | yecD | isochorismatase family protein YecD | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGGTTGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGTGTGAGGCACGATTTTGTTTTTTCAGGAGTCATTATGCTTGAACTTAATGCTAAAACCACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCGCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAAC > NC_000913/1950446‑1951033 | cgGTTGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCNCAGCGTTAGCTGTATGTCAAAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTAACACTCTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCAAGTTTGCTGTCACGGTGTTGCCCGaa > 2:451727/1‑299 (MQ=255)cgGTTGACCCAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCAAAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGNTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAAc > 1:127431/1‑300 (MQ=255) cAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTACCTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCATGGCCAGCGCTGGAACGCCTAGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCAAGTTTGCTCTAAAGGTGTTGCCCGAACTCACaaa > 2:216963/1‑298 (MQ=255) cAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATaaaaa > 1:150648/1‑300 (MQ=255) cAACCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATaaaa > 2:67922/1‑299 (MQ=255) aaCCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAACTGTCCACAATATTCTGTACGCATTAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAAt < 2:65948/300‑1 (MQ=255) aCCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTTCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAAtt > 1:605424/1‑300 (MQ=255) aCCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCATGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAAtt > 2:372654/1‑300 (MQ=255) aCCACACAGAGTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCATTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAAtt > 1:550958/1‑300 (MQ=255) gagTCACCTGCTGCCCCACGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAAt > 1:42028/1‑300 (MQ=255) 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aCGTGGGACAAACGGAGCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATc > 1:474246/1‑299 (MQ=255) gCTGTCCACAATATTCTTTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTTCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTaatg < 2:346922/300‑3 (MQ=255) gCTGTCCACAATATTCTGTATGCATTAGATATCCCGTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCTCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAgg < 2:152857/300‑1 (MQ=255) gCTGTCCACAATATTCTGTACGCATTAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTaatg < 2:522166/300‑3 (MQ=255) gCTGTCCACAATATTCTGTACGCATTAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAgg < 2:522174/300‑1 (MQ=255) gCTGTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCNCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCNGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAgg < 2:453832/300‑1 (MQ=255) gTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGgtgt > 1:244043/1‑300 (MQ=255) gTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCATGAAATCAGACTCTAAGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGgt > 2:240720/1‑298 (MQ=255) gTCCACAATATTCTGTACGCATGAGATATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCCATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGTTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCAAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTCACAAAGTTTGTCGTTCCGACATCGGCTAATCGCATTAAGgtgt > 2:246566/1‑300 (MQ=255) 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agaTATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGTGTGAGGCACGATTTTGTTTTTTCa > 2:403621/1‑299 (MQ=255) agaTATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCAAAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTAGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGTGTGAGGCACGATTTTGTTTTTTCa > 1:144507/1‑299 (MQ=255) agaTATCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCAAAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAACCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCCCTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGTGTGAGGCCCAATTTTGTTTTTTCa > 2:403683/1‑299 (MQ=255) atCCCTTAACTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATAATGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCACGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCAGCCATCGGCTAATCGCAGTAAGGTGTGAGGCATGATTTTGTTTTTTCAGGAGt > 2:54149/1‑300 (MQ=255) aCTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTGTGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGAAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACTCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGTGTGAGGCACGATTTTGTTTTTTCAGGAGTCATTATGc < 2:335963/300‑1 (MQ=255) aCTTAGCTGCCGGCGGATGCCCCCTGCTGCGCAGGTGACCAAGTCGCAGCGTTAGCTGTATGTCACAACTGAATGAAAAAAGGCGGCTATTATACTGGGAATTCTGCCGCACCGTAAGAGCCTGGCCCGCGCTGGAACGCCTCGTTACCACTTTATATCGGGCCTGAAATCAGACTCTACGCCAGTTTGCTATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGTGTGAGGCACGATTTTGTTTTTTCAGGAGTCATTATGc < 2:335681/300‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
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| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |