| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,651,851 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+1866/+873) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 78 (1.000) | 45/590 | 0.4 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1651855 | 0 (0.000) | intergenic (+1870/+873) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1651851 = | 0 (0.000) | 108 (1.390) | 57/590 | 0.1 | 100% | intergenic (+1866/+877) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651256‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGCG < NC_000913/1651855‑1651560 CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCT > 1:377902/1‑300 AGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTA < 2:273739/300‑1 TCGCCCGGATGTTTGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGNATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCC < 2:449459/300‑1 GGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCATGGATCTGGTATCCAGTCAG < 1:324278/300‑1 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GGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTT < 1:554836/291‑1 GGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTT > 2:554836/1‑291 GTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCGGTAATTCTTTACGAACCTACAGTAATTTTTCTTTATTcat > 2:66259/1‑297 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GCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTGAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATATGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGANGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCT < 2:438713/300‑1 ATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTGTTAATCGATTAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGTCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATC < 2:270796/297‑1 TTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTTTAATGGGTTAAGTGATAACAAATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTCTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATC < 2:270847/284‑1 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GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATGGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGAATATTTTTGATGACGGCACGATATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTC > 1:294263/1‑300 GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAATAATTTTTCTTTCTTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGNTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTAAACAAATTTTTCAAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGT > 2:198220/1‑299 GGTTAAGTGATAACAAATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACATCCAATAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCCGTGCCAAAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTTTCGGGCCTCGCCAAATTTTTCCCGATTGCGTGCGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGT > 1:293370/1‑299 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ATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGANATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGNTGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCAACAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGC > 2:463868/1‑300 TCCAGGGATATGATATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGATGCAAGATTTTTTTCGCCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGTCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCATAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGCG < 2:597045/300‑1 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NC_000913/1651256‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGCG < NC_000913/1651855‑1651560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |