| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,380,367 | C→T | D51N (GAC→AAC) | frdB ← | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,380,367 | 0 | C | T | 99.1% | 388.4 / NA | 112 | D51N (GAC→AAC) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (56/55); minor base G (1/0); total (57/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACC‑AGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATAC‑GGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGC > NC_000913/4380077‑4380652 | ggAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACC‑AGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCAAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATAC‑GGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTTCGGTGCCa > 2:132828/1‑299 (MQ=255) 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agcGCCATAT‑GGCAGGACCATCGGTAACTCAGGTTCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTNAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTNCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTCCACGTCGCTGTACTCCAGGCg < 2:663465/298‑1 (MQ=255) aTCGCCATAC‑GGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTTCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCg < 1:339093/300‑1 (MQ=255) c‑GGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTTCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGcc > 2:504997/1‑300 (MQ=255) ggCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTTCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATTAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCa < 2:805896/300‑1 (MQ=255) gACCAGCGGTAGCTCAGGTTCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGc > 1:53041/1‑300 (MQ=255) cGGTAGCTCAGGTTCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATcgc > 1:334345/1‑299 (MQ=255) | GGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACC‑AGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATAC‑GGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTC‑TTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGC > NC_000913/4380077‑4380652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |