| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,337,390 | C→T | K180K (AAG→AAA) | adiY ← | DNA‑binding transcriptional activator AdiY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,337,390 | 0 | C | T | 98.8% | 589.3 / 0.1 | 173 | coding (540/762 nt) | adiY | DNA‑binding transcriptional activator AdiY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (85/86); minor base . (1/1); total (86/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TTGAATTATTATCGACCGGGTTATCGCTGATGCCGTTATTAATATAGCTCTTCGTTAAGGTTAAAAATCAGGCGACAGTGCGTTCTCTGTGCTGACTAACATAATGCAGCGGCGTCATACCGTAGAAGTCTTTAAAGACAGAAATAAAGTACGACGTACTGTTGTAGCCGCAGGACTGTGATACCTGAGAGATATTTTTACCGTCCATCATTAATTCATTTACGGCATAACGCATGCGGCAGGTGGTGATTATTTGGCTATAACTGGTGTTTTCGCTTTTCAACTTTTTCTTT‑AACAGACTTGGGCTAAGACATAAACAACTGGCTACCATACTAAGATTCCAGTCTTTGTGAATATCGCTTTCAATAATTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACATATACATCATTAATGAAACGAATTTTTTACTGTCGAGAAAACGGGATAGCACCG‑TGAATAATAATGCGCGTGTTCGTTCCTTTTCTGACTCAGTTTCTGCGGGCATCATGCTGTGTTGCGCGGCAACGCGAAAGACGTCTGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGC > NC_000913/4337101‑4337682 | ttGAATTATTATCGACCGGGTTATCGCTGATGCCGTTATTAATATAGCTCTTCGTTAAGGTTAAAAATCAGGCGACAGTGCGTTCTCTGTGCTGACTAACATAATGCAGCGGCGTCATACCGTAGAAGTCTTTAAAGACAGAAATAAAGTACGACGTACTGTTGTAGCCGCAGGACTGTGATACCTGAGAGATATTTTTACCGTCCATCATTAATTCATTTACGGCATAACGCATGCGGCAGGTGGTGATTATTTGGCTATAACTGGTGTTTTCGCTTTTCAACTTTTTTTTT‑AACAGAc < 1:505631/300‑1 (MQ=255) 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TTGAATTATTATCGACCGGGTTATCGCTGATGCCGTTATTAATATAGCTCTTCGTTAAGGTTAAAAATCAGGCGACAGTGCGTTCTCTGTGCTGACTAACATAATGCAGCGGCGTCATACCGTAGAAGTCTTTAAAGACAGAAATAAAGTACGACGTACTGTTGTAGCCGCAGGACTGTGATACCTGAGAGATATTTTTACCGTCCATCATTAATTCATTTACGGCATAACGCATGCGGCAGGTGGTGATTATTTGGCTATAACTGGTGTTTTCGCTTTTCAACTTTTTCTTT‑AACAGACTTGGGCTAAGACATAAACAACTGGCTACCATACTAAGATTCCAGTCTTTGTGAATATCGCTTTCAATAATTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACATATACATCATTAATGAAACGAATTTTTTACTGTCGAGAAAACGGGATAGCACCG‑TGAATAATAATGCGCGTGTTCGTTCCTTTTCTGACTCAGTTTCTGCGGGCATCATGCTGTGTTGCGCGGCAACGCGAAAGACGTCTGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGC > NC_000913/4337101‑4337682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |