| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,651,851 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+1866/+873) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 99 (0.890) | 61/588 | 0.4 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1651855 | 0 (0.000) | intergenic (+1870/+873) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1651851 = | 0 (0.000) | 131 (1.180) | 82/588 | 0.1 | 100% | intergenic (+1866/+877) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651256‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGC < NC_000913/1651855‑1651561 CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTAGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGACAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAATGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGGGATCT > 2:482885/1‑300 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GGCAAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTATTTCCGACCCTCCCGTAACTTCTCTTTATTAATCGATGAGACAAGATTTTTTTAACAGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGGAATTTTTAAGCCAGTTCTTTTCTGGTTCACTCTTGTCGGGCCTCACCCAATTCTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAAAAAACAGA > 1:481595/1‑300 AAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACTGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGG < 1:485605/299‑1 AAATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGG < 1:113214/299‑1 AATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTCATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACAAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGA > 2:309122/1‑299 ATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGNCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGC > 2:698809/1‑300 ATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGACTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACAACAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGC > 2:232708/1‑300 ATCCAGGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTAAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGC > 1:70589/1‑300 CGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651256‑1651548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGATCTGGTATCCAGTCAGTAACTCTTTACGAACCTCCAGTAATTTTTCTTTATTAATCGATGAGGCAAGATTTTTTTCACCGATTATGCTCAGGATATTTTTGATGACGGCACGGTATGTGTTGAGTGATGTTTTGGCGACTTCAGTTTCTTTCAGTGCCAGAAATTTTTCAGCCAGTTCTTTTATGGTTAAATCTTGTCGGGCCTCACCAAATTTTTCCAGATTGCGTGAGGAGGGAAACTGTTTTGCATAGTCGAAAACACCAGTTTTTATTGCGTAACAAACAGAGGAGC < NC_000913/1651855‑1651561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |