| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_012971 | 2,227,497 | 2 bp→AA | coding (2284‑2285/2628 nt) | gyrA ← | DNA topoisomerase (ATP‑hydrolyzing) subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_012971 | 2,227,497 | 0 | G | A | 100.0% | 242.7 / NA | 73 | P762L (CCA→TTA) | gyrA | DNA topoisomerase (ATP‑hydrolyzing) subunit A |
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| * | NC_012971 | 2,227,498 | 0 | G | A | 100.0% | 248.0 / NA | 73 | P762L (CCA→TTA) | gyrA | DNA topoisomerase (ATP‑hydrolyzing) subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (42/31); total (42/31) | |||||||||||
CTGCCATCGATGGTGTCCAGATCTTCCTCGTCAACCGGTTCAGCAACGCGTTGCAGACCCACTACGTTTTCATCTTCCGCAGTACGGATGAGGATCACGCCCTGAGTGTTACGGCCCACGATGCTGATTTCCGAAACGCGAGTACGCACCAGCGTACCAGCATCGGTGATCATCATGATCTGGTCGCAGTCATCTACCTGCACCGCGCCAACCACTAAACCGTTACGTTCGGTAACCTTGATGGAGATAACCCCTTTCGTCGCACGCGACTTGGTTGGGTATTCCGCCACTGCGGTACGTTTACCGTAACCGTTTTGCGTTGCGGTGAGGATTGCCCCTTCGCCACGCGGTACGATCAGAGAAACGACTTTATCGCCTTCGCCTAAACGGATACCGCGCACACCGGTGGTGTTGCAGCCCATCGCACGGACGGAAGACTCTTTAAAGCGCACCACTTTACCTTCGGCGGAGAACAGCATTACTTCGTCTTCGCCGCTGGTCAGGTCAACGCCGATCAGCTCATCGCCTTCAACCAGTTTGATCGCCACTTTACCGGCAGTACGCAGAC > NC_012971/2227221‑2227788 || cTGCCATCGATGGTGTNCAGATCTTCCTCGTCAACCGGTTCAGCAACGCGTTGCAGACCCACTACGTTTTCATCTTCCGCAGTACGGATGAGGATCACGCCCTGAGTGTTACGGCCCACGATGCTGATTTCCGAAACGCGAGTACGCACCAGCGTACCAGCATCGGTGATCATCATGATCTGGTCGCAGTCATCTACCTGCACCGCGCCAACCACTAAACCGTTACGTTCGGTAACCTTGATGGAGATAACCCCTTTCGTCGCNCGCGACTTGGTTAAGTATNCCGCCACTGCGGTACGt > 1:679342/1‑300 (MQ=255)cTGCCATCGATGGTGTCCAGATCTTCCTCGTCAACCGGTTCAGCAACGCGTTGCAGACCCACTACGTTTTCATCTTCCGCAGTACGGATGAGGATCACGCCCTGAGTGTTACGGCCCACGATGCTGATTTCCGAAACGCGAGTACGCACCAGCGTACCAGCATCGGTGATCATCATGATCTGGTCGCAGTCATCTACCTGCACCGCGCCAACCACTAAACCNTTACGTTCGGTAACCTTGATGGAGATAACCCCTTTCGTCGCACGCGACTTGGTTAAGTATTCCGCCACTGCGGTACGt > 1:174629/1‑300 (MQ=255) cATCGATGGTGTCCAGATCTTCCTCGTCAACCGGTTCAGCAACGCGTTGCAGACCCACTACGTTTTCATCTTCCGCAGTACGGATGAGGATCACGCCCTGAGTGTTACGGCCCACGATGCTGATTTCCGAAACGCGAGTACGCACCAGCGTACCAGCATCGGTGATCATCATGATCTGGTCGCAGTCATCTACCTGCACCGCGCCAACCACTAAACCGTTACGTTCGGTAACCTTGATGGAGATAACCCCTTTCGTCGCACGCGACTTGGTTAAGTATTCCGCCACTGCGGTACGTTTAc > 1:748817/1‑300 (MQ=255) gtCCAGATCTTCCTCGTCAACCGGTTCAGCAACGCGTTGCAGACCCACTACGTTTTCATCTTCCGCAGTACGGATGAGGATCACGCCCTGAGTGTTACGGCCCACGATGCTGATTTACGAAACGCGAGTACGCACCAGCGTACCAGCATCGGTGATCATCATGATCTGGTCGCAGTCATCTACCTGCACTGCGCCAACCACTAAAACGTTACGTTCGGTAACCTTGATGGAGATAAACCCTTTCGTCGAACGCGACTTGGTTAAGTATTCCGCCACTGCGGTACGTTTACTGTAACCGtt > 2:32434/1‑300 (MQ=255) 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CTGCCATCGATGGTGTCCAGATCTTCCTCGTCAACCGGTTCAGCAACGCGTTGCAGACCCACTACGTTTTCATCTTCCGCAGTACGGATGAGGATCACGCCCTGAGTGTTACGGCCCACGATGCTGATTTCCGAAACGCGAGTACGCACCAGCGTACCAGCATCGGTGATCATCATGATCTGGTCGCAGTCATCTACCTGCACCGCGCCAACCACTAAACCGTTACGTTCGGTAACCTTGATGGAGATAACCCCTTTCGTCGCACGCGACTTGGTTGGGTATTCCGCCACTGCGGTACGTTTACCGTAACCGTTTTGCGTTGCGGTGAGGATTGCCCCTTCGCCACGCGGTACGATCAGAGAAACGACTTTATCGCCTTCGCCTAAACGGATACCGCGCACACCGGTGGTGTTGCAGCCCATCGCACGGACGGAAGACTCTTTAAAGCGCACCACTTTACCTTCGGCGGAGAACAGCATTACTTCGTCTTCGCCGCTGGTCAGGTCAACGCCGATCAGCTCATCGCCTTCAACCAGTTTGATCGCCACTTTACCGGCAGTACGCAGAC > NC_012971/2227221‑2227788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |