| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_012971 | 550,663 | G→A | pseudogene (114/364 nt) | ECD_RS02680 → | prophage tail fiber N‑terminal domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_012971 | 550,663 | 0 | G | A | 99.2% | 394.7 / NA | 117 | pseudogene (114/364 nt) | ECD_RS02680 | prophage tail fiber N‑terminal domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (68/48); total (68/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CATGGCTGGTAAATGGCTGGTATCCCACAGCAAGTATCAGCGATTTGCTGGTTGTGGTGATGAAGAAAGCCACTGCAGGCATCATGATTAGCTGAATTTTATAACCCAGATACGGGCGCCAGAAATGGCGCCTTTTTTATTTGTGGAGTGAATATGGCAGTACAGATTTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTGGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTTGAGCATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCAGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCGGCACGCAACGCCGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCGGCAAAGAAATCCGAAACTGCAGCGGCATCAT > NC_012971/550397‑550958 | tggccattgaccttgcttatgaaggttccggcagtggtgactggcgcactgacggtttcatcgtgggggtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTAc > 2:22090‑M1/157‑300 (MQ=255) gccatttaccttgcgtatgaaggttccggcagtggtgactggcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAANCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAg > 2:575062‑M1/155‑300 (MQ=255) attgaccttgcttatgaaggttccggcagtggtgactggcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCAt > 1:79686‑M1/152‑300 (MQ=255) ttatgaaggttccggcagtggtgactggcgcacggacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccangtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACTACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGgatgtcgag > 1:154344‑M1/141‑295 (MQ=255) ttccggcagtggtgactggcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCAAGGTACTGGTGAACACGGTAGCATATGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTatggcaagt < 2:755412‑M1/169‑5 (MQ=255) ggcagtggtgacttgcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccnccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTAc > 2:627309‑M1/128‑298 (MQ=255) ggcagtggtgacttgcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTAc > 2:805674‑M1/128‑298 (MQ=255) ggcagtggtgactggcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTAc > 1:72106‑M1/128‑298 (MQ=255) ggcagtggtgactggcgcactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTAc > 2:805424‑M1/128‑298 (MQ=255) ggcagtggtgactggcgcactgacgggttcagcgtgggtgtcggtgataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccnccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTAc > 2:627299‑M1/128‑298 (MQ=255) tgactggcgcactgactgtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCANTACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGNGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCAccc > 2:616661‑M1/120‑300 (MQ=255) cactgacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagcaaggtaacacagtgttatgacggcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACCGAACTGCACTCTTCAACTGAAGGCAAAGAGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCAACATGCTGGtt < 2:175014‑M1/189‑1 (MQ=255) gacggtttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGt > 1:542656‑M1/107‑282 (MQ=255) ttcatcgtgggtgtcggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAANTCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTcc < 1:170990‑M1/200‑1 (MQ=255) cggttataaattctgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCAACCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATgca < 2:646520‑M1/213‑2 (MQ=255) ttctgatgatccgggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTTAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAACGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTAc > 2:375969‑M1/77‑300 (MQ=255) tgattagccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCg > 1:242031‑M1/74‑299 (MQ=255) gccaggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGa < 1:695551‑M1/233‑1 (MQ=255) aggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTTGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGaa < 1:319081‑M1/234‑1 (MQ=255) aggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGaa > 2:44941‑M1/65‑298 (MQ=255) aggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGaa > 1:649036‑M1/65‑298 (MQ=255) aggtaacacagtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAgg > 1:549778‑M1/65‑300 (MQ=255) agtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAcc > 1:89806‑M1/56‑300 (MQ=255) agtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAc > 1:101413‑M1/56‑299 (MQ=255) gtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTAACGTCTATGAAGGTTCCAGacct < 1:99502‑M1/246‑2 (MQ=255) gtgttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCAGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGACTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGacct < 2:10682‑M1/246‑2 (MQ=255) ttatgacagcccgccggttcaggcgggcttttttgtggagtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTG‑GGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTa > 1:201264‑M1/52‑300 (MQ=255) gaagatatcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATg > 1:535885‑M1/40‑298 (MQ=255) gatatcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGAtttt < 1:617557‑M1/264‑1 (MQ=255) atatcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTtc < 1:11122‑M1/265‑1 (MQ=255) tatcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAAc > 1:72330‑M1/35‑252 (MQ=255) tatcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCATCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAAc < 2:72330‑M1/218‑1 (MQ=255) tcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCGCTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCg > 1:417302‑M1/33‑300 (MQ=255) tcgtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCg > 1:417190‑M1/33‑300 (MQ=255) gtaccggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCCGAATGATTTTCTCGGt < 1:227137‑M1/270‑1 (MQ=255) acctgtgccgtcagctccgaatatggcaGCATTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCTTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATTTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTCCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGc > 2:167036‑M1/29‑300 (MQ=255) ggggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCAt < 2:73696‑M1/275‑1 (MQ=255) ggccgtcagctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGa > 1:483654‑M1/24‑300 (MQ=255) gctccgaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAgat > 1:793356‑M1/16‑300 (MQ=255) gtggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTAGGTGCCATGACGGAAgatgat < 2:796282‑M1/288‑1 (MQ=255) ggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGt < 1:133670‑M1/290‑1 (MQ=255) ggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGt < 2:506929‑M1/290‑1 (MQ=255) ggatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGAAGGAAGATGATGt < 1:134478‑M1/290‑1 (MQ=255) ggatatggcaGCAGTAAAAATCTAAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGCATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATAATGt < 2:344570‑M1/290‑1 (MQ=255) gaatatggcaGCAGTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTATGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGt < 2:189752‑M1/290‑1 (MQ=255) gaatatggcaGCAGTAAAAATCTAAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTATGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGAAGGAAGATGATGt < 2:186811‑M1/290‑1 (MQ=255) gaatagggcaGCATTAAAAATCTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACGGGATTGTACTATTTAATGGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCCGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGAGGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGt > 2:699105‑M1/11‑300 (MQ=255) gcagtaaaaatctCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAg < 1:105944/288‑1 (MQ=255) agtaaaaatctCAGGTGTGCTGAAGGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAAGCCGGATGAAGCCGGGTGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCGTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAGGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGc < 2:679567/290‑1 (MQ=255) agtaaaaatctCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAgg < 1:222169/289‑1 (MQ=255) agtaaaaacctCAGGTGTGCTGAAAGGTGGTTCGGGAAAACCAATACAGAACTACACTAGTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGAATGAAGCCAGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCCATTAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGc < 2:166710/260‑1 (MQ=255) gtgCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCNAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGa > 1:596345/1‑299 (MQ=255) gtgCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATC‑GGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAgg < 1:783454/300‑1 (MQ=255) gCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGc > 1:443323/1‑300 (MQ=255) gCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCGGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGc > 2:657702/1‑300 (MQ=255) gAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCAGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAAt > 1:23452/1‑300 (MQ=255) aaGATGGTGCTGGAAGACCAAGACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAATGTTTTCCTCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAAtgg < 2:186157/300‑1 (MQ=37) gggAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTATTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGTGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAGCCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGc < 2:698735/300‑1 (MQ=255) aaaCCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGGCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAgcagca < 1:653958/300‑1 (MQ=255) aaCCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTAGGTGCCATGAAGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCAc > 2:360615/1‑300 (MQ=255) aaCCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATNTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCAc > 1:168889/1‑300 (MQ=255) ccAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTATGAAAATCCGGATGAAGCAGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCACGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGc > 2:18430/1‑300 (MQ=255) aTACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAAc > 1:107006/1‑300 (MQ=255) gAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGAAGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGctga > 1:245048/1‑297 (MQ=255) gAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGACATGAAGGAAGATGACGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGctga > 2:309909/1‑297 (MQ=38) aaCTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGTAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGc < 1:697041/296‑1 (MQ=255) aCTGCACTATTCAACTGAAGTCAGGGTGTAACAGCACCACGGTACTAGTAAACACGTTGGCTTCTGAAAATCCGGATTAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATTGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAg < 2:764350/300‑1 (MQ=255) aCTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAATGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAg < 2:695551/300‑1 (MQ=255) cTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTAGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAgc > 2:549131/1‑300 (MQ=255) tGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAgcc < 1:82481/300‑1 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGGAGCCGGGCGTTACAACATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCAGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCCTGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCGTTGCGTTGTTTTGAGGAAGTGGTGGAAGAAGcagcccgccactatgaagccgactct > 2:175177/1‑275 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGGCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAcc < 1:419119/185‑1 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGGCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAcc > 2:418583/1‑185 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGGCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAcc > 2:419119/1‑185 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGGCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAcc < 1:419247/185‑1 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGGCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGAcc < 1:418583/185‑1 (MQ=255) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCCGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGCAGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCctct > 2:90895/1‑300 (MQ=38) aTTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTTGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCctct > 1:67983/1‑300 (MQ=255) aaCTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGTAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCag < 1:105444/299‑1 (MQ=255) aaCTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCag < 1:105430/299‑1 (MQ=255) ttaatgCAAATCGTAACAGCACCACGGTGCTGGGGAACACGGTAGCTTATGAAAATCCGGATGAAGCCAGGCGTTACAGCATAGATGTCGAGTATGGCCATTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGGTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGAGTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATTTCATGCCGTAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAgc < 2:277651/294‑1 (MQ=255) ttaaGGCAAATCGTAACAGCACCCCGGTAATGGTGAACAAGGTAGCCTCTGAAAATCCGTATGAAGCCGGGCGTTACAGCATAGATTGCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTTAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTTAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAgc < 2:336676/297‑1 (MQ=255) tGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAAGCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAgc < 1:477582/299‑1 (MQ=255) tGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAgc < 1:650557/299‑1 (MQ=255) gaatgcagaGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGGATGGCCAGTACAGCGTCATCCTGCTGGTGGAAGGTGTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCGTGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAgc < 2:439391/290‑1 (MQ=37) gCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGATGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAgcggcagc > 2:757824/1‑297 (MQ=38) cAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCAGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCAACCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCATCTCAGCGTGCCACGGCAGCAAAGaa > 2:26131/1‑300 (MQ=255) ccacGGTACTGGTGAACATGGTAGCATCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGACATTGCGTCGTTTTGAGGCAACGGTGAAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGaaacca > 2:210416/1‑296 (MQ=38) ccacGGTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGAATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAATACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCACTACCGTCTATGAAGATTCCAAACCTAGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATAACAGAAGATGATATCACACCAGAGGCATTGCGTCGTTTTGCAGCAATGGCGGAAGAAACAGCACGCAACACCGAAACCACCTCCCAAAGCGCAGCAGCAGCCAAGaaacca > 2:81884/1‑296 (MQ=255) gTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAAca > 2:778557/1‑299 (MQ=38) gTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCAGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAGTCAGAAAca > 2:311709/1‑299 (MQ=38) gTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTAGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAAca > 1:58166/1‑299 (MQ=38) gTACTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCAGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAAca > 2:471668/1‑299 (MQ=255) gTACTGGTGAACACGGNAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCNTCTCAGAGCGCAGCGGCANCAAAGAAATCAGAAAca > 1:667081/1‑299 (MQ=38) cTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAACAGCa > 1:780/1‑300 (MQ=38) cTGGTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCAACCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAACAGCa > 1:223/1‑300 (MQ=38) ggTGAACACGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAACagcagc > 2:461322/1‑300 (MQ=38) acGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGAAGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGTATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCAGCCTCTAAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAACAGCAGCGGcatca > 2:184084/1‑300 (MQ=38) cGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAGTCAGAAACAGCAGCGGcatcat > 2:476283/1‑300 (MQ=38) cGGTAGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTCGAGTATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCTGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCAGCACGCAACGCTGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCAGCAAAGAAATCAGAAACAGCAGCGGcatcat > 2:476289/1‑300 (MQ=38) | CATGGCTGGTAAATGGCTGGTATCCCACAGCAAGTATCAGCGATTTGCTGGTTGTGGTGATGAAGAAAGCCACTGCAGGCATCATGATTAGCTGAATTTTATAACCCAGATACGGGCGCCAGAAATGGCGCCTTTTTTATTTGTGGAGTGAATATGGCAGTACAGATTTCAGGTGTGCTGAAAGATGGTGCGGGAAAACCAATACAGAACTGCACTATTCAACTGAAGGCAAAGCGTAACAGCACCACGGTACTGGTGAACACGGTGGCCTCTGAAAATCCGGATGAAGCCGGGCGTTACAGCATGGATGTTGAGCATGGCCAGTACAGCGTCACCCTGCTGGTTGAAGGTTTTCCGCCTTCACATGCCGGAACCATTACCGTCTATGAAGGTTCCAGACCAGGTACGCTGAATGATTTTCTCGGTGCCATGACGGAAGATGATGTCATGCCGGAGGCATTGCGTCGTTTTGAGGCAATGGTGGAAGAAGCGGCACGCAACGCCGAAGCCGCCTCTCAGAGCGCAGCGGCGGCAAAGAAATCCGAAACTGCAGCGGCATCAT > NC_012971/550397‑550958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |