Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_012971 791,198 C→T intergenic (‑628/+228) ECD_RS03990 ← / ← ybhB hypothetical protein/kinase inhibitor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_012971791,1980CT100.0% 158.4 / NA 47intergenic (‑628/+228)ECD_RS03990/ybhBhypothetical protein/kinase inhibitor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (24/23);  total (24/23)

TGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCAT  >  NC_012971/791102‑791491
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                                                                                        tCACTAATATCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTTTGTTTTACAGTATTTTGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGAc     <  1:420500/300‑1 (MQ=255)
                                                                                        tCACTAATATCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTTTGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGAc     <  1:420489/300‑1 (MQ=255)
                                                                                         cACTAATATCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTTTGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTACGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAAATAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCAAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGAcc    >  1:48084/1‑300 (MQ=255)
                                                                                         cACTAATATCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTTTGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGAcc    >  1:15230/1‑300 (MQ=255)
                                                                                           cTAATATCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTTTGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCAt  >  1:60632/1‑300 (MQ=255)
                                                                                                 |                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
TGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCAT  >  NC_012971/791102‑791491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: