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ttGGTAATGGTATAATCGCGCGTTTACACTTATTCAGAACGATTTTTTTTCAGTAGACACGAACATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAATCTGGGTCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCAAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCCTGGCGTGATAAAGCGACCGGCGAGATGAAAGAGCAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAgg < 2:747960/296‑1 (MQ=255) ttGGTAATGGTAGAATCGCGCGTTTACACTTATGCAGAACGATTTTTTTGCAGGAGACACGAACATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAATCTGGTGCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCAAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCCTGGCGTGATAAAGCGACCGGCTAGATGAAAGAGCAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGtt < 2:120859/298‑1 (MQ=255) gTAATGGTATAATCGCGCGTTTACACTTATTCAGAACGATTTTTTTTCAGGAGACACGAACATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAANCTGGGTCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCNAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCCTGGCGTGATAAAGCGACCGGCGAGATGAAAGAGCAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAACCTGGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTatat > 2:615776/1‑300 (MQ=255) tGGTATAATCGCGCGTTTACACTTATTCAGAACGATTTTTTTTCAGGAGACACGAACATGGCCCGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAATCTGGGTCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCAAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCTTGGCGTGATAAAGCGACCGGCGAGATGAAGGAGCAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTAGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTCCATCGaa > 2:430712/1‑300 (MQ=255) tGGTATAATCGCGCGTTTACACTTATTCAGAACGATTTTTTTTCAGGAGACACGAACATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAATCTGGGTCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCAAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCCTGGCGTGATAAAGCGACCGGCGAGATGAAAGAGCAGACTGAATGNCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGaa > 1:572641/1‑300 (MQ=255) tGGTATAATCGCGCGTTTACACTTATTCAGAACGATTTTTTTTCAGGAGACACGAACATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAATCTGGGTCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCAAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCCTGGCGTGATAAAGCGACCGGCGAGATGAAAGAGCAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGaa > 1:698688/1‑300 (MQ=255) | GCCCGGTCACGACAATGAGCTTGTCGCGGGGGATAACGAGGTTGATGTTTTTGAGATTATGGGTGCGGGCGCCCCGAACTTCGATCTTATCCATTCACCTTTCCCGGATTAAACGCTTTTTT‑GCCCGGTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCTGAATGAATATACAGTATTGGAATGCATTACCCGGAGTGTTGTGTAACAATGTCTGGCCAGGTTTGTTTCCCGGAACCGAGGTCACAACATAGTAAAAGCGCTATTGGTAATGGTACAATCGCGCGTTTACACTTATTCAGAACGATTTTTTTTCAGGAGACACGAACATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGGTTATTCTCGTTGGTAATCTGGGTCAGGACCCGGAAGTACGCTACATGCCAAATGGTGGCGCAGTTGCCAACATTACGCTGGCTACTTCCGAATCCTGGCGTGATAAAGCGACCGGCGAGATGAAAGAGCAGACTGAATGGCACCGCGTTGTGCTGTTCGGCAAACTGGCAGAAGTGGCCAGCGAATATCTGCGTAAAGGTTCTCAGGTTTATATCGAA > NC_012971/4181187‑4181777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |