| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 3365925 | NA (NA) | 134 (1.390) | 76/590 | 0.0 | 100% | pseudogene (474/480 nt) | ECD_RS16845 | aminotransferase class I/II‑fold pyridoxal phosphate‑dependent enzyme |
| ? | NC_012971 | = 4153660 | 0 (0.000) | coding (132/1191 nt) | malE | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
AATCAGCGATAACGCTTCAACAGCGATCGGGTAAGCAATCAGCTTGCCGTTGTAACGTACGGCATCCCAGGTAAACGGATACAGCTTGTCCTGGAACGCTTTGTCCGGGGTGATTTCAGCCAACAGGCCAGATTGAGCGTAGCCACCAAAGCGGTCGTGTGCCCAGAAGATAATGTCAGGGCCATCGCCAGTTGCCGCAACCTGTGGGAATTTCTCTTCCAGTTT‑ATCCGGATGCTCAACGGT‑GACTTTA‑ATTCCGGTATCTTTCTCGAATTTCTTACCGACTTCAGCGAGACCGTTATAGCCTTTATCGCCGTTAATCCAGATTACCAGTTTACCTTCTTCGATTTTGGCGAGAGCCGAGGCGGAAAACATCATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTGTTTTTATTTTCATAATCTATGGTCCTTGTTGGTGAAGTGCTCGTGAAAACACCTAAACGGACTCTAGTTTCTTTATACGGCAACCTCTTTCCATCCTCCTTGCCCCTACGCCCCACCGTCGCTTTGTGTGATCTCTGTTACAGAATTGGCGGTAATGTGGAGATGCGCACATAAAA > NC_012971/4153366‑4153954 | aGCGATAACGCTTCAACAGCGATCGGGTAAGCAATCAGCTTGCCGTTGTAACGTACGGCATCCCAGGTAAACGGATACAGCTTGTCCTGGAACGCTTTGTCCGGGGTGATTTCAGCCAACAGGCCAGATTGAGCGTAGCCACCAAAGCGGTCGTGTGCCCAGANGATAATGTCAGGGCCATCGCCAGTTGCCGCAANCTGTGGGAATTTCTCTTCCAGTTT‑ATCCGGATGCTCAACGGT‑GACTTTA‑ATTCCGGTATCTTTCTCGAATTTCTTACCGACTTCAGCGAGACCGggtgatgc > 2:618539‑M2/1‑291 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |