| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 739290 | 99 (1.030) | 6 (0.080) | 6/438 | 5.9 | 9.4% | noncoding (76/76 nt) | ECD_RS03620 | tRNA‑Lys |
| ? | NC_012971 | 739580 = | 42 (0.590) | intergenic (+1/‑51) | ECD_RS03630/ECD_RS03635 | tRNA‑Lys/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGA > NC_012971/739282‑739876 | gACCCACCAATCGCTANGGTGGAAGCGGTAGTAAANCGTGAAGGATAACGTTGCATCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATNCTGCACGACCcaccac < 1:677822/299‑1 (MQ=255)gACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCcaccac < 1:452741/299‑1 (MQ=255) aCCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTCGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGAAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTa > 2:495407/1‑300 (MQ=255) accaATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt < 1:603303/299‑1 (MQ=255) 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aTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTGGAGTCCTCCTACACGACCCACCACTGCCATGGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGACTAGCTAAGTTGG‑GAGCGCACCTCCCTTACAAGGCGGGGGTCGGCGATTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACTGGGTCGTTCGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTGATCAATTGGTCGCAGGTTTGAATCCTGCACGAACCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGGAGTAGTGTGCAGTAt > 1:233192/1‑282 (MQ=255) aTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGGAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGt > 1:232091/1‑299 (MQ=255) aTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATGCTACCGTCAGTTGTAGTATCCAAAGTGGTATTG‑TGTAATTAGCTCAGCTAG‑GAAAGTCCATCCCTTCCAAGGAGGTAGTCATCAGCTCGCCCCCGCCCTTA‑ACCACCACCTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATTGGATTTTAATTTAGTGATTGTAGGGTCGAGTCCTGCACGACACACAAATCCTTACGGTGGGTTCGGTGGGAGTAGTGTGGGGTATCCAGTGCAGtcgcgggt > 1:232278/1‑292 (MQ=255) 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GACCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATTG‑GGTGATTAGCTCAGCTGG‑GAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCA‑CCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGA > NC_012971/739282‑739876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |