| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 930604 | 63 (0.650) | 5 (0.060) | 5/472 | 6.8 | 9.5% | noncoding (118/136 nt) | ECD_RS22710 | RtT sRNA |
| ? | NC_012971 | 930960 = | 45 (0.580) | noncoding (69/88 nt) | ECD_RS04720 | tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGTGGAACGGTGAAAACCCTATTTTTGGAGGTGAAGGTAAGTTGTTGATAATTAGTGCTGCTGGAAGGTAAGGATAAAAAAGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTG‑CTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCTGGAGTGCATTATGC > NC_012971/930309‑930899 | ggttGGAACGGTGAAAACCCTATTTTTGGAGGTGAAGGTAAGTTTTTGATAATTAGTGCTGCTGGAAGGTAAGGATAAAAAAGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTG‑CTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACt < 1:757874/297‑1 (MQ=255)gggTGGAACGGTGAAAACCCTATTTTTGGAGGTGAAGGTAAGTTGTTGATAATTAGTGCTGCTGGAAGGTAAGGATAAAAAAGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTG‑CTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGGTTGACt > 1:402099/1‑300 (MQ=255)gggTGGAACGGTGAAAACCCTATTTTTGGAGGTGAAGGTAAGTTGTTGATAATTAGTGCTGCTGGAAGGTAAGGATAAAAAAGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTG‑CTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACt > 1:736527/1‑300 (MQ=255)gggTGGAACGGTGAAAACCCTATTTTTGGAGGTGAAGGTAAGTTGTTGATAATTAGTGCTGCTGGAAGGTAAGGATAAAAAAGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTG‑CTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACt > 2:49338/1‑300 (MQ=255) 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(MQ=38) tttGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCAGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTc > 1:796166/1‑293 (MQ=255) cTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGTATTATGCGAACAAAAGCTCGCACTTTTGTACGAGCTCTTCTTTa > 1:284079/1‑300 (MQ=255) cTGCCGTACAGGCAGCNTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCNAAAAAAAGCTCGCACTTTNGTACGAGCTCTTGTTTa > 1:675895/1‑300 (MQ=255) gTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGTTGATGTGGGGATTGACTCGCTTCACTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGACTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCTGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAat < 2:181603/298‑1 (MQ=255) gCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATTCGAAAAAAAGCTCGc > 1:226662/1‑263 (MQ=255) gCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGa > 1:226627/1‑299 (MQ=255) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAggggg < 1:777180/300‑1 (MQ=255) aaaTTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCAACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAggggggg < 1:495098/300‑1 (MQ=255) aCATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTATTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCAACACCCCGGGATTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTAAGGACTTTTATTGAAATCTGACGGTGAGGGGGGAATTGACccgcttc > 2:335686/1‑300 (MQ=17) aCATACTCCAACCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTAGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCC‑GGAGTGCCTTATTCGAAAAAAAGCTCGCa > 2:337106/1‑244 (MQ=255) ccaTGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAATCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGc > 1:524480/1‑300 (MQ=255) gTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCTGGGCTTATCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATCTGGTGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCTCTCGCACCGCGGACAGCCcac > 1:386935/1‑300 (MQ=17) 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tACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTc < 1:721501/300‑1 (MQ=255) agaTAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCTGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTc < 1:239147/299‑1 (MQ=255) gCGAAAAAAAAGCTCGCACGTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGNCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCTGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTg < 1:152396/300‑1 (MQ=255) gcagTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCGGCCCACTCACTGCGTGCGTGGGCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGGTGTCGAATCCCGGGCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGGGCATTATGTGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCTgg < 2:524480/297‑1 (MQ=21) gggttGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCACCTGGAGTGCATTATGCAAAAAAAAGCTCGCACTTTCATACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGAGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCCGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCTGGAGTGCATTATGc > 1:767241/4‑300 (MQ=255) ggATTGACGCGCGTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCTGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCTGGAGTGCATTATGc < 1:498896/300‑1 (MQ=255) | GGGTGGAACGGTGAAAACCCTATTTTTGGAGGTGAAGGTAAGTTGTTGATAATTAGTGCTGCTGGAAGGTAAGGATAAAAAAGGGTGCTGCAGGAGAATGGGATGGTTTTG‑CTTTATTAACAACGGGCTAAACGTGTAGTATTTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCCTGGAGTGCATTATGCGAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCACTCACTGCGTTCGTGGTCTGTCCAACTGGCTGCGCCAGTTGTCGAACCCCGGTCGGGGCTTCTCACCCCCCTGGAGTGCATTATGC > NC_012971/930309‑930899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |