| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_012971 | 88,456 | 0 | G | T | 31.2% | 176.2 / 10.6 | 125 | E8* (GAG→TAG) | ilvI | acetolactate synthase 3 large subunit |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCCGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTTTCACCTTTCCTCCTGTTTATTCTTATTACCCCGTGTTTATGTCTCTGGCTGCCAATTGCTTAAGCAAGATCGGACGGTTAATGTGTTTTACACATTTTTTCCGTCAAACAGTGAGGCAGGCCATGGAGATGTTGTCTGGAGCCGAGATGGTCGTCCGATCGCTTATCGATCAGGGCGTTAAACAAGTATTCGGTTATCCCGGAGGCGCAGTCCTTGATATTTATGATGCATTGCATACCGTGGGTGGTATTGATCATGTATTAGTTCGTCATGAGCAGGCGGCGGTGCATATGGCCGATGGCCTGGCGCGCGCGACCGGGGAAGTCGGCGTCGTGCTGGTAACGTCGGGTCCAGGGGCGACCAATGCGATTACTGGCATCGCCACCGCTTATATGGATTCCATTCCATTAGTTGTCCTTTCC > NC_012971/88160‑88734 | gCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCCGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTTTCACCTTTCCTCCTGTTTATTCTTATTACCCCGTGTTTATGTCTCTGGCTGCCAATTGCTTAAGCAAGATCGGACGGTTAATGTGTTTTACACATTTTTTCCGTCAAACAGTGAGGCAGGCCATGGAGATGTTGTCTGGAGCCgaga < 2:710383/300‑1 (MQ=255) 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ggcCATGGAGATGTTGTCTGGAGCCGAGATGGTCGTCCGATCGCTTATCGATCAGGGCGTTAAACAAGTATTCGGTTATCCAGGAGGCGCAGTCCTTGATATTTATGATGCATTGCATACCGTGGGTGGTATTGATCATGTATTAGTTCGTCATGAGCAGGCGGCGGTGCATATGGCCGATGGCCTGGCGCGCGCGACCGGGGAAGTCGGCGTCGTGCTGGTAACGTCGGGTCCAGGGGCGACCAATGCGATTACTGGCATCGCCACCGCTTATATGGATTCCATTCCATTAGTTGTCCt > 1:467639/1‑300 (MQ=255) gagaTGTTGTCTGGAGCCGAGATGGTCGTCCGATCGCTTATCGATCAGGGCGTTAAACAAGTATTCGGTTATCCCGGAGGCGCAGTCCTTGATATTTATGATGCATTGCATACCGTGGGTGGTATTGATCATGTATTAGTTCGTCATGAGCAGGCGGCGGTGCATATGGCCGATGGCCTGGCGCGCGCGACCGGGGAAGTCGGCGTCGTGCTGGTAACGTCGGGTCCAGGGGCGACCAATGCGATTACTGGCATCGCCACCGCTTATATGGATTCCATTCCATTAGTTGTCCTTTcc > 2:126904/1‑297 (MQ=255) | GCATTTTTTATTGAATGTAGAATTTTATTCTGAATGTGTGGGCTCTCTATTTTAGGATTAATTAAAAAAATAGAGAAATTGCTGTAAGTTGTGGGATTCAGCCGATTTATTATCAATTTAATCCTCCGTAATGGAGGATTTTATCGTTTCTTTTCACCTTTCCTCCTGTTTATTCTTATTACCCCGTGTTTATGTCTCTGGCTGCCAATTGCTTAAGCAAGATCGGACGGTTAATGTGTTTTACACATTTTTTCCGTCAAACAGTGAGGCAGGCCATGGAGATGTTGTCTGGAGCCGAGATGGTCGTCCGATCGCTTATCGATCAGGGCGTTAAACAAGTATTCGGTTATCCCGGAGGCGCAGTCCTTGATATTTATGATGCATTGCATACCGTGGGTGGTATTGATCATGTATTAGTTCGTCATGAGCAGGCGGCGGTGCATATGGCCGATGGCCTGGCGCGCGCGACCGGGGAAGTCGGCGTCGTGCTGGTAACGTCGGGTCCAGGGGCGACCAATGCGATTACTGGCATCGCCACCGCTTATATGGATTCCATTCCATTAGTTGTCCTTTCC > NC_012971/88160‑88734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |