| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGGCTGTTGAACCACCAGGGACAACTGATCAAACGTCCGTTCCGTCTGGAAGGAGTGCAAACTCAGGATGGTTACGATGAGATGGTTAAAGTGCTAGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTCACATTTTTTGTACAACCGACATGCCCGTGTAGCTCACAAATATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGACGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCACATTTAGTAATCACTGTTTTCTTTTCCACCAGAAACCAGTATGAGGGAAACGAGGCATGAAGAGACAAAAACGAGATCGCCTGGAACGGGCACATCAACGTGGTTATCAGGCCGGTATCGCCGGACGCT > NC_012971/1020279‑1020876 | cTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGGCTGTTGAACCACCAGGGACAACTGATCAAACGTCCGTTCCGTCTGGAAGGAGTGCAAACTCAGGATGGTTACGATGAGATGGTTAAAGTGCTAGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACACGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTcc > 1:471296/1‑300 (MQ=255) 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ccGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTAACATTTTTTGTACAACCGACATGCCAGTGTAGCTCACCACTATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGAAGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCATATTTAGTCATCACTGTTTTCTTTTCCACCAGAAACCAGTATGAGGGAAACGAGGCCTGaa > 2:452751/1‑232 (MQ=255) ccGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTATAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTCACATTTTTTGTACAACCGACATGCCCGTGTAGCTCACAAATATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGAAGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCCCATTTAGTAATCACTGTTTTCTTTTCCACCAGAAACCAGTATGAGGGAAACGAGGCATGAAGAGACAAAAACGAGATCGCCTGGAACAGGCACATCAACGTGGTTATCAGGCAGGTATCGACGGACGCt > 2:452928/1‑300 (MQ=255) | CTGCCCGGCTGGGTGGTTGCCTCCCAGCCTCTGGGAAGCGCCCAGGACACGCTCAATGTTACCGTAACGGAGTTTAACGGTCGCTATGATGGCAAGGTCATTGTCAGTGGTGAGTGGCTGTTGAACCACCAGGGACAACTGATCAAACGTCCGTTCCGTCTGGAAGGAGTGCAAACTCAGGATGGTTACGATGAGATGGTTAAAGTGCTAGCCGGTGTCTGGAGTCAGGAAGCCGCTTCTATTGCACAAGAGATAAAGCGTCTACCTTAATTATAAAGATTTGTAAATATAACCGTCTCCGGTATGTTGCCTGAGGCGGTTTTTTTGTCTCTAACGTGCGGAAAAATTTGTTCCTCTTCACATTTTTTGTACAACCGACATGCCCGTGTAGCTCACAAATATGACAGTGGCGTGAATTTTGCGCATTGACGGCAGTTATGATTCGCGGTATTGCTTAACTGTGATTGCACATTTAGTAATCACTGTTTTCTTTTCCACCAGAAACCAGTATGAGGGAAACGAGGCATGAAGAGACAAAAACGAGATCGCCTGGAACGGGCACATCAACGTGGTTATCAGGCCGGTATCGCCGGACGCT > NC_012971/1020279‑1020876 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |