| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 739290 | 113 (1.080) | 7 (0.090) | 6/436 | 6.5 | 8.5% | noncoding (76/76 nt) | ECD_RS03620 | tRNA‑Lys |
| ? | NC_012971 | 739786 = | 66 (0.850) | intergenic (+1/‑146) | ECD_RS03640/ECD_RS03645 | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGA > NC_012971/739488‑740067 | gTCACCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 1:15368/299‑1 (MQ=255) tcatcaCCCACCACCGGTTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCTTGCACGACCCACCACTAATTACGGTTGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 1:303397/298‑1 (MQ=255) acccaccACCGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGtttt > 2:54745/1‑297 (MQ=255) acccaccACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAc > 2:55537/1‑300 (MQ=255) 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gCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTaa > 1:803673/1‑299 (MQ=255) aGTTTACTTTTAATCAATTGGTCACAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAACTACGGCGTGTGCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCACAGTATCGGGCGATTAGCTCAGCTTGGATGGAACCTACATTACAAGTAGGGGGTATGTGTTTAGATCTCGTGGGCACGCAGAAGTAGAGGAGGGAGAGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGt < 1:53861/299‑1 (MQ=255) aGTTGACTGTTAAGCAATTGGTCGCAGGTGCGACTCCTGCACGACCCACCACTAAGTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGG‑TTGTAGTACCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCTGCTGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGt < 1:54127/299‑1 (MQ=21) 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ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTACTTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCCGCGCCTCATCGAGTAATTAGCTCAGCTGAGAAAGCCCCTCCCTTCCCAGGAAAGGTTCAGCGGCTCAATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGATCGAGTAGTTGACTTTCAATCACTTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTaa > 2:808976/1‑257 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACGTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGgcga > 1:142214/1‑299 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGgcga > 1:142224/1‑299 (MQ=255) 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agt‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGNTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGt > 1:157724/1‑300 (MQ=255) agt‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAATCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGNTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCAACAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGt > 1:157606/1‑300 (MQ=255) agt‑TTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCAGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGCTGTTAAGCGTGAAGGATAACGNTACGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGt > 1:157827/1‑300 (MQ=255) 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tCCCTTATAAGGAGGGGGTCCGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACGCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 2:142214/298‑1 (MQ=255) tCCCTTACAAGGAGGTGGTCGGCGGTTCGATCTCTTCATCACCCACCACTCTGGTCGTTGGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 2:220538/298‑1 (MQ=255) tCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 2:142224/298‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |