| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 3510532 | 121 (1.160) | 13 (0.150) | 12/472 | 4.7 | 10.8% | intergenic (‑358/‑382) | dinQ/arsR | damage‑inducible type I toxin DinQ/As(III)‑sensing metalloregulatory transcriptional repressor ArsR |
| ? | NC_012971 | 3510764 = | 118 (1.400) | intergenic (‑590/‑150) | dinQ/arsR | damage‑inducible type I toxin DinQ/As(III)‑sensing metalloregulatory transcriptional repressor ArsR | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGC‑TAATTCTTGCAATGTTAG‑CCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCC > NC_012971/3510235‑3510825 | ccgcATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGAACAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTAAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTAACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAAACGACGCAAAGTAGGTTTTTTTACAt > 2:316417/2‑300 (MQ=255) ttGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCCGACCAGGACTTTGAAAGCATTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGAc < 2:401097/300‑1 (MQ=255) aGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAat < 2:509391/300‑1 (MQ=255) gAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTACCTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTCGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACCAGGCTTCata > 1:478480/1‑300 (MQ=255) gAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAata > 2:94110/1‑300 (MQ=255) gAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTAAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAat > 2:108433/1‑299 (MQ=255) ctctctCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGa > 1:14590/1‑300 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACTAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTAAGGGCTGGAAAGTAAAAAAACGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGaa > 1:200104/1‑298 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCGGATTCAGAcccaacttcacatga > 1:796754/1‑284 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGAc > 1:200117/1‑299 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGATAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTCGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGAAAAGGCTTAACATgca > 2:97493/1‑297 (MQ=255) aCTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCATAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGAc < 2:356938/300‑1 (MQ=255) aCTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGAc < 1:501976/300‑1 (MQ=255) 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gTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAAACGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATaaa > 2:479333/1‑300 (MQ=255) caccCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTAAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACt > 1:197690/1‑297 (MQ=255) gTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatat < 1:636347/299‑1 (MQ=255) gTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCNCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatat < 2:609039/299‑1 (MQ=255) tACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatatat < 1:791950/300‑1 (MQ=255) tACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatat < 2:796735/298‑1 (MQ=255) tACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAAAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatat < 2:797819/298‑1 (MQ=255) aCTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTNTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGAtatata > 1:178780/1‑300 (MQ=255) cttatGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCATAAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCa > 2:362264/5‑287 (MQ=255) 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ggTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGC‑TAATTCTTGCAATGTTAG‑CCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAcc < 1:30665/300‑1 (MQ=255) ggTTGTTTTACATCCGGATGCGGACAATGCTGAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCTTCACTGCGATATATATCGAAGTACTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGC‑TAATCCTTGCAATGTTAG‑CCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTa < 2:769736/298‑1 (MQ=39) gTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGC‑TAATTCTTGCAATGTTAG‑CCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCt < 1:97530/300‑1 (MQ=255) | GCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGATATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGC‑TAATTCTTGCAATGTTAG‑CCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCC > NC_012971/3510235‑3510825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |