| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 656615 | 84 (0.800) | 15 (0.190) | 13/432 | 4.0 | 20.9% | intergenic (‑1/+15) | ECD_RS03205/ECD_RS03210 | tRNA‑Met/tRNA‑Gln |
| ? | NC_012971 | 657008 = | 52 (0.680) | intergenic (‑2/+379) | ECD_RS03225/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthase B | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
ATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAAT > NC_012971/656334‑656907 | aTGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGc < 1:737244/300‑1 (MQ=255)aTGCCGGAAGCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGAttgc < 1:737195/300‑4 (MQ=255) agaccccGGTGCCTTACCCCTTGGCGATACCCCAACTGGTGGCACTTACACGGTAATCGTCTTTAATAACTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTg < 1:309109/295‑1 (MQ=38) tCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAAACTGGGGGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGTCTGGTGTACGAGGATTCGAACCGCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTGCCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 2:544525/300‑1 (MQ=255) gTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAGATCGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTAGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAACAATTGGTTTTGAATTTGCCGCACATATTCGACATATTTAAACTTTGGTAGCTACGACGGGGTTCAAACCT‑ACACACCCCTCATTCCGAGTGATGTGCTCTAAACAACTTGGTCAAGTAGCAAGATTGTTTCGTCTATGGTTGGGGTCCCTGGATTctaa > 2:23099/1‑297 (MQ=19) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCCGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGCC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACAAACTGAGTTAAGTAGCCAAACTGTTTCTTAGATGGCTGGGGTACCTggcttagaaac > 1:60034/1‑291 (MQ=38) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAcc > 1:298177/1‑300 (MQ=255) ttACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTANGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCa > 1:159207/1‑298 (MQ=255) aCCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGATTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa < 2:425820/300‑1 (MQ=255) cTTGGCGATACCCCAACTGGGTACACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACATCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAAACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGc > 1:452820/1‑300 (MQ=255) ttGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGc < 1:236368/299‑1 (MQ=255) aTACCCCAAATGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGCAGCAAGGTTGTTCCTCAGATGGCTGAGGTACCTGGATTCGAAACAGGGAATGCAGGTATc > 2:39188/1‑300 (MQ=38) ccccAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGCATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAGGTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCCGAATTTGGTGGCTACGATGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTCTGCGTGATGTGCTCTCCCCAACTTAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaa > 2:427444/1‑300 (MQ=38) ccccAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaa > 1:117855/1‑300 (MQ=255) aaCTGGTTGCACTTACAAGGGAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGAGTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGNGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATNATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc < 2:631764/299‑1 (MQ=255) gggTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGCGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGt > 1:201760/1‑299 (MQ=255) cACTTACAAGTGAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGGGCCTGACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCatcttttttttcgcgataccttatc < 1:543012/253‑25 (MQ=25) cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa < 2:115419/271‑1 (MQ=255) cTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa > 1:115419/1‑271 (MQ=255) tACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGc < 1:725518/300‑1 (MQ=255) aGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGTGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGCATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTAAGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGCTTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCACAAACCGGTGCCTTACCGCtt > 1:120487/1‑298 (MQ=255) aTAAGTTGGCTGGGTTACGAGGATTCGAATTTCGGGATGTCGGAGTC‑GAGATTCGGTGTCTTACTGCTTGTCGATACCTTAACAAATTGGTTTTGAATTGGTTGAACGTATTCGACGCATTCAGAATTTGGTGGTTAAGACGGGATGCGGACCTGTGAC‑TCCGTCGTTATGAGTGAGGTGCTTTAACTAACGGAGCTCCTTGGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAc < 2:733984/300‑1 (MQ=16) aTAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAc < 1:66587/300‑1 (MQ=255) ggCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAAATAACTGGGc > 2:444126/1‑298 (MQ=255) ggCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAAACACCTTGGTCTTGAATTTGCCGCACATATTCGACAAATTCAGAATTTGGTGGCTACGCAGGGATTCGAACCTGTGAA‑CCCATCATTATGAGTGATGTGTTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCGGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACATGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCACAAACCGGTGc > 2:443856/1‑266 (MQ=37) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCCGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAACGGTGCATTACCGCTTGGCGATACCCCACTAACCGGGCGGTGAAc > 2:468020/1‑300 (MQ=255) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGTTGTCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGCGACGTACCCCAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGAGGGTTTCTTCGACGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 1:22869/281‑1 (MQ=38) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATATTTTTTCTTAGATGACCGGATCACCTGGATTCGCACCCATTAACGCCATTCCCAAACACCGGTGCCTTACCGCCTGGCGATACCCCACTAACCGGGCGGTGAAc > 1:584848/1‑300 (MQ=25) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAcggggttc > 1:281252/1‑255 (MQ=255) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAAACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATATTTTttctcaga > 1:526882/1‑204 (MQ=255) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCAGGAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCACATGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTATTCGCTNGCTGGGGTCCCTGGCTTCGAACCCGGGAATGCCGGTCTCACAACCCGGTGCCCCACCGCTTGGCGATACCCCAATCACAGGGCGGTgcac > 2:656810/1‑297 (MQ=38) 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gAATCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATGGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAc < 2:299582/299‑1 (MQ=255) aaTCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACTACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTAccc < 1:549473/300‑2 (MQ=255) aTCAGA‑ATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGACACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAC‑CCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGANTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCGGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTg < 2:598321/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |