| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,926,991 | G→A | L5L (CTG→TTG) | asnC ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator AsnC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,926,991 | 0 | G | A | 99.2% | 423.7 / ‑3.5 | 127 | coding (13/459 nt) | asnC | DNA‑binding transcriptional dual regulator AsnC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (80/46); minor base . (1/0); total (81/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GTGTAATAGGCTTCAGTGACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAGATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGCTTTTTATTGAATGATTATTGCATGTGTGTCGGTTTTTGTTGCTTAATCATAAGCAACAGGACGCAGGAGTATAAAAAATGAAAACCGCTTACATTGCCAAACAACGTCAAATTAGCTTCGTGAAATCTCACTTTTCTCGTCAACTGGAAGAACGTCTGGGGCTGATCGAAGTCCAGGCGCCGATTCTTAGCCGTGTGGGGGATGGCA > NC_000913/3926702‑3927284 | gtgtAATAGGCTTCAGTGACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCACGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTcc > 1:325237/1‑300 (MQ=255) gtAATAGGCTTCAGTGACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGACCCGGTAATGATCCACGCCTGCTTCATTTTCTCTAATCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGACAATTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTACAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTACAt > 2:228345/1‑300 (MQ=255) gCTTCAGTGACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGAttt > 1:467123/1‑300 (MQ=255) tCAGTGACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATANAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCt < 1:189104/300‑1 (MQ=255) gACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGc < 1:319512/300‑1 (MQ=255) ttCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCACGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGattcat > 1:692640/1‑300 (MQ=255) aGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑Ta > 2:739041/1‑300 (MQ=255) tttGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TAttt < 1:238653/300‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTGGGCGCGCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGTTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATACTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TAttt < 1:238366/298‑1 (MQ=255) aGCGCGTAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAg < 2:778612/297‑1 (MQ=255) 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ctTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGt > 1:502179/1‑300 (MQ=255) ctTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTAATCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTACAGGATGCC‑ACGGTACAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGt > 2:111931/1‑300 (MQ=255) ctTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTAATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGAGTAAGCGGTGAGCGCATTGCCCATTAATGCTTACAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCCTTC‑TATTCTAGCATTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGt > 2:348552/1‑300 (MQ=255) ctTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCAGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCCGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCAATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAACGTGAGt > 2:110473/1‑300 (MQ=255) ctTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCACAGGTAATGATCAACGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCAGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGAGCGCATTGCCCATTAATGCCTACAGTATGCC‑ACGGTCCAGAGTGTCGATACA‑ATAATTTTCCATGGGGTTTTCTTCTGCTGATTGATGATTCATTC‑TATTGTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATAAAAAGTGa > 2:348393/1‑298 (MQ=255) tttAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGt < 2:829385/299‑1 (MQ=255) atatAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCGTTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTAGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCACATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCCTAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGc > 2:572118/1‑300 (MQ=255) gCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGCTTTTTAt < 1:538543/300‑1 (MQ=255) gcagcCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGTTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAAGCGTCCACGGACTGACGCCAAAGTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATGCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGCTTTTTATTGAATGatt < 2:852201/300‑1 (MQ=255) 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gATTGTCGAT‑CAAATAACTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGCTTTTTATTGAATGATTATTGCATGTGTGTCGGTTTTTGTTGCTTAATCATAAGCAACAGGACGCAGGAGTATAAAAAATGAAAACCGCTTACATTGCCAAACAACGTCAAATTAGCTTCGTGAAATCTCACTTTTCTCGTCAACTGGAAGAACGTCTGGGGCTGATCGAAGTCCAGGCGCCGATTCTTAGCCGTGTggggg < 2:467123/300‑1 (MQ=255) ttGTCGAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGCTTTTTATTGAATGATTATTGCATGTGTGTCGGTTTTTGTTGCTTAATCATAAGCAACAGGACGCAGGAGTATAAAAAATGAAAACCGCTTACATTGCCAAACAACGTCAAATTAGCTTCGTGAAATCTCACTTTTCTCGTCAACTGGAAGAACGTCTGGGGCTGATCGAAGTCCAGGCGCCGATTCTTAGCCGTGTGGGGGAt < 2:502179/300‑1 (MQ=255) gAT‑CAAATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTATGCTTTTTATTGAATGATTATTGCATGTGTGTCGGTTTTTGTTGCTTAATCATAAGCAACAGGACGCAGGAGTATAAAAAATGAAAACCGCTTACATTGCCAAACAACGTCAAATTAGCTTCGTGAAATCTCACTTTTCTCGTCAACTGGAAGAACGTCTGGGGCTGATCGAAGTCCAGGCGCCGATTCTTAGCCGTGTGGGGGATGGCa < 1:406269/299‑1 (MQ=255) | GTGTAATAGGCTTCAGTGACTTCATCAAGGCTTTCCAGCTTTGCCAGCGCGGAAGGGTAGTCTTTGGCGCTCTTTAATATAATGCCGATAAAGCAGCCTACGTCATAACCGAGCTGCTTCGGGCTGACATCAATACGCGCCCCGGTAATGATCCCCGCCTGCTTCATTTTCTCTACTCGAACGTGAATCGTCCCCGGACTGACGCCAAATTGTTTCGCCAGTTCGGCGTAAGCGGTGCGCGCATTGCCCATTAATGCTTCCAGGATGCC‑ACGGTCCAGATTGTCGAT‑CAGATAATTTTCCATAGGATTTTCTTATGCGGATTGATGATTCATTC‑TATTTTAGCCTTCTTTTT‑TAATGAATCAAAAGTGAGTTAGGCTTTTTATTGAATGATTATTGCATGTGTGTCGGTTTTTGTTGCTTAATCATAAGCAACAGGACGCAGGAGTATAAAAAATGAAAACCGCTTACATTGCCAAACAACGTCAAATTAGCTTCGTGAAATCTCACTTTTCTCGTCAACTGGAAGAACGTCTGGGGCTGATCGAAGTCCAGGCGCCGATTCTTAGCCGTGTGGGGGATGGCA > NC_000913/3926702‑3927284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |