| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,123,617 | IS2 (–) +5 bp | coding (836‑840/1026 nt) | cytR ← | DNA‑binding transcriptional repressor CytR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 4123617 = | 0 (0.000) | 98 (0.950) | 64/590 | 0.2 | 100% | coding (840/1026 nt) | cytR | DNA‑binding transcriptional repressor CytR |
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| * | ? | NC_000913 | = 4123621 | 0 (0.000) | 110 (1.070) | 64/590 | 0.2 | 100% | coding (836/1026 nt) | cytR | DNA‑binding transcriptional repressor CytR |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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cTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTATCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCAAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCCATCCCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 2:849680/1‑300 (MQ=9) cTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCAATTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 2:690177/1‑300 (MQ=14) cTTGTAGACTGGCCCCATGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATCGTCTTAATACTAGTTTTTAGAATAGTCATTGGCGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGGAACGCAGACGGCGTACCAAAAAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCANAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTCGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACAAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCTCCGGAGAACAGGTTGTTc > 2:284782/1‑300 (MQ=11) | AGAAAGGTTTATCAGTCCATTTGAATATGCAAAGATTAATAATCCATTAAAACAGTAATCATCCCGGGCAAATGCCCGGGAATTATTCTAGGATTATTTTCTTTGTTAAAAAAGACAAACGGTATTAACTGATGTATTTACTATTTACCGCTCCCTGCAGGGGGGATTATCAGAATCCGCGGTTATTCATTATTTATATACATTCAATAAAAAAGTAACCTCATAAAAAATCCTGTACTCACAGGGTGATGCGGGATAACTGACGTAAGGAGTGCTGCAGGGATTTGATGGTCCCTTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTC > NC_000913/4497883‑4498476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |