| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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ttGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATg < 2:725609/300‑1 (MQ=255) aaTTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAATGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATNTCAGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTc < 1:608880/300‑1 (MQ=255) tGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCNGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTAt < 1:190198/300‑1 (MQ=255) gAATCTACAGTTGCTTGTTGTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGTGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCTTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTACTCATTATTAGCTc < 2:2057/281‑1 (MQ=255) aaTCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTAttt > 1:814513/1‑300 (MQ=255) aaTCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTAttt < 2:87133/300‑1 (MQ=255) | GAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTTGCTTTTTTTAATATATCTCGCTCAAGGCGAGCTTCATTTAACGCCTTACGCAGTTGCAGAATTTCAGATTCCAGTTCA‑GCCACCGTGCGGGAACCAGGAGTACCGAGCCCTTTTCTGGCGGCGGTAACCCATTGTCCTAAAGTGCCTTCAGGAAGAGATAATCGGGAAGCGCCTTCACTGATCGAAAGTTGATTTTCAAGAACCGTTCTGACAGCTTCGGCTTTGAACTTTTTAGAGTAACGTTGGGTTTTTCTGCTCATTATTAGCTCCTTCTGATGCCATTCTATTT > NC_000913/4508386‑4508971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |