| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 4507459 = | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
GAGTTATTCAGCGAAGAAAATCTACAAATTCTGAGCGAAAAACTGGAATTTGACGCCTATCTGGCGCTACTTCGTCAGTGCGATCTTGGTTACTTTATTTTTGCCCGCCAGCAGGGCATTGGTACGCTGTGCTTACTGATTCAGGCGGGCATTCCTTGTGTGCTTAACCGGGAAAATCCGTTCTGGCAGGATATGACGGAACAACATTTGCCGGTGCTGTTTACTACCGACGATCTCAACGAGGATATTGTGCGTGAAGCGCAGCGCCAGTTGGCGTCGGTGGATAAAAACACCATTGCCTTCTTTAGCCCTAACTATCTACAAGGCTGGCAGCGGGCGTTGGCGATTGCCGCCAGGGAGGTCGCATGAGTCTGCTGCAATTCAGTGGCCTGTTTGTTGTCTGGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTGTTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTGATGTTGGTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGT > NC_000913/3978236‑3978814 | gAGTTATTCAGCGAAGAAAATCTACAAATTCTGAGCGAAAAACTGGAATTTGACGCCTATCTGGCGCTACTTCGTCAGTGCGATCTTGGTTACTTTATTTTTGCCCGCCAGCAGGGCATTGGTACGCTGTGCTTACTGATTCAGGCGGGCATTCCTTGTGTGCTTAACCGGGAAAATCCGTTCTGGCAGGATATGACGGAACAACATTTGCCGGTGCTGTTTACTACCGACGATCTCAACGAGGATATTGTGCGTGAAGCGCAGCGCCAGTTGGCGTCGGTGGATAAAAACACCATTGcc > 1:511513/1‑300 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attgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCCTTCTTTAGCACTAACTATCTACAAGGCTGGCAGCGGGCGTTGGCGATTGCCGCCAGGGAGGTCGCATGAGTCTGCTGCAATTCAGTGGCCTGTTTGTTGTCTGGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTGTTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTGATGTTGgt < 2:739330‑M1/263‑1 (MQ=255) gtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCCTTCTTTAGCCCTAACTATCTACAAGGCTGGCAGCGGGCGTTGGCGATTGCCGCCAGGGAGGTCGCATGAGTCTGCTGCAATTCAGTGGCCTGTTTGTTGTCTGGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTGTTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTGATGTTGGTGTCGcgccgc < 2:211127‑M1/273‑1 (MQ=255) gcattgacagattgaatctacaATTGCCTTCTTTAGCCCTAACTATCTACAAGGCTGGCAGCGGGCGTTGGCGATTGCCGCCAGGGAGGTCGCATGAGTCTGCTGCAATTCAGTGGCCTGTTTGTTGTCTGGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTGTTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTGATGTTGGTGTCGCGCCGCCAGaa < 1:737025‑M1/278‑1 (MQ=255) | GAGTTATTCAGCGAAGAAAATCTACAAATTCTGAGCGAAAAACTGGAATTTGACGCCTATCTGGCGCTACTTCGTCAGTGCGATCTTGGTTACTTTATTTTTGCCCGCCAGCAGGGCATTGGTACGCTGTGCTTACTGATTCAGGCGGGCATTCCTTGTGTGCTTAACCGGGAAAATCCGTTCTGGCAGGATATGACGGAACAACATTTGCCGGTGCTGTTTACTACCGACGATCTCAACGAGGATATTGTGCGTGAAGCGCAGCGCCAGTTGGCGTCGGTGGATAAAAACACCATTGCCTTCTTTAGCCCTAACTATCTACAAGGCTGGCAGCGGGCGTTGGCGATTGCCGCCAGGGAGGTCGCATGAGTCTGCTGCAATTCAGTGGCCTGTTTGTTGTCTGGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTGTTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTGATGTTGGTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGT > NC_000913/3978236‑3978814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |