| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,223,636 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+187/+639) | ymgJ → / ← minE | uncharacterized protein YmgJ/Z‑ring positioning protein MinE |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1223640 | 0 (0.000) | 94 (0.920) | 56/588 | 0.4 | 100% | intergenic (+191/+639) | ymgJ/minE | uncharacterized protein YmgJ/Z‑ring positioning protein MinE |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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TAAGCGTACGACAGTATTATCAGAAAAGAGTGATTTTTTATCCAACTACACTTCAGCGCACTGCGTGTAAAAAATGCCTCTTTCTTATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCGATACCCGCAGTATATATCGTGAACTGGGTGCAACGCTGAGTTACAACATGCGCCTGGGGAACGGTATGGAAATGAACCCTGGCTGAAGGCGGCTGTGCGCAAAGAATTTGTCGATGATAACCGGGTGAAGGTGAATAATGACGGTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTCATTCAGCAGTACGTTTAGCGGACATCTCGGGGTGGGGTATAGCCATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCGTGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCATCAACGATTAAACTGCGCT > NC_000913/1223337‑1223929 | ggaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCTg > 1:278080‑M1/298‑300 (MQ=255) 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tatCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCGATACCCGCAGTATATATCGTGAACTGGGTGCAACGCTGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccc < 1:308880‑M1/300‑91 (MQ=255) tcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCNATACCCGCAGTATATATCGTGAACTGGGTGCAACGCTGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgc < 2:607043‑M1/300‑96 (MQ=255) tcatGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGTGCTGATGTTGCATCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCGATACCCGCAGTATATATCGTGAACTGGGTGCAACGCTGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcg < 2:11954‑M1/300‑104 (MQ=255) 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TAAGCGTACGACAGTATTATCAGAAAAGAGTGATTTTTTATCCAACTACACTTCAGCGCACTGCGTGTAAAAAATGCCTCTTTCTTATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCGATACCCGCAGTATATATCGTGAACTGGGTGCAACGCTGAGTTACAACATGCGCCTGGGGAACGGTATGGAAATGAACCCTGGCTGAAGGCGGCTGTGCGCAAAGAATTTGTCGATGATAACCGGGTGAAGGTGAATAATGACGGTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTCATTCAGCAGTACGTTTAGCGGACATCTCGGGGTGGGGTATAGCCATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCGTGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCATCAACGATTAAACTGCGCT > NC_000913/1223337‑1223929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |