| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 538183 | 91 (0.890) | 29 (0.280) | 21/586 | 3.6 | 24.2% | coding (551/1455 nt) | ybbW | putative allantoin transporter |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGT‑ATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTG‑GTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCC‑GACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTAT > NC_000913/537884‑538477 | cAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTAACGGGCTTAATTAATTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCAc > 2:560553/1‑300 (MQ=255) gTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGGTTTCACTCTTTTAGGCATTTCTCTACTGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACt > 2:432357/1‑299 (MQ=255) gTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACt > 1:734944/1‑299 (MQ=255) aTACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCAt > 1:518906/1‑300 (MQ=255) gCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTAACGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAAccc > 2:513566/1‑300 (MQ=255) ccATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTCACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCt > 2:709456/1‑300 (MQ=255) ccATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCt > 2:709315/1‑300 (MQ=255) 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gtgtACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGa > 2:779248/1‑300 (MQ=255) gtgtACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCATTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTACCCCGTGCATCTATATCGTCTTCGGCGGTATGGCGa > 2:105426/1‑300 (MQ=255) gtACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTatat < 1:204824/278‑1 (MQ=255) 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ttttAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGTCGGTATGGCGATTTGTGCGATTTCACTGGGCGGGATCGGTCCAATCTTCGACGANATTCCGAGCGGT‑ATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTG‑GTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGGCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCC‑GACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAgggg < 2:277967/273‑4 (MQ=255) aatTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGANCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGT‑ATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTG‑GTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCC‑GACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGgtatgta < 1:618334/300‑1 (MQ=255) atTCACTGCCATTCTTACCCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCAATGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGT‑ATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTG‑GTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCC‑GACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTAGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGgtatgtat > 2:222592/1‑300 (MQ=255) | CAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAG‑TTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGT‑ATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTG‑GTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCC‑GACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTAT > NC_000913/537884‑538477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |