| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1067753 = | 167 (1.380) | intergenic (‑45/‑328) | wrbA/ymdF | NAD(P)H:quinone oxidoreductase/stress‑induced bacterial acidophilic repeat motifs‑containing protein YmdF | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCA > NC_000913/1067458‑1068048 | gACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCAc < 1:611671/300‑1 (MQ=255) gCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGTCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATGCGCTACCACTTATTTag < 2:946693/300‑2 (MQ=255) aGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGCTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTAGTGTTATCTATATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATa > 2:391777/1‑300 (MQ=255) gggTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGa > 1:20972/1‑300 (MQ=255) gggTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCATAGTGTTATCTATATTCCGTAGCGATTCGCTActgtagattcaattggtcaa > 2:526301/1‑281 (MQ=255) ggTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGAc > 1:1283/1‑300 (MQ=255) aGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTc > 1:753187/1‑300 (MQ=255) 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GACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATGCA > NC_000913/1067458‑1068048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |