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Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
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acttgttcgcaccgtccTTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATAcc < 1:291071‑M2/283‑1 (MQ=255) atatTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTAttt < 1:547014/300‑1 (MQ=255) ccATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCAATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTACGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTCTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTAtt > 2:378650/1‑300 (MQ=255) | AAGACTGGCCCAGTCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAA > NC_000913/313430‑314025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |