| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3648146 | 152 (1.260) | 13 (0.130) | 13/472 | 5.1 | 9.8% | intergenic (+2/‑148) | agrA/agrB | small RNA AgrA/small regulatory RNA AgrB |
| ? | NC_000913 | 3648378 = | 118 (1.220) | intergenic (+3/‑150) | agrB/arsR | small regulatory RNA AgrB/DNA‑binding transcriptional repressor ArsR | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGC > NC_000913/3647849‑3648444 | aGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTTTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGNCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGc < 2:781150/300‑1 (MQ=255) gAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAata > 1:132115/1‑300 (MQ=255) tctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGAc < 2:592324/300‑1 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGAc > 1:326835/1‑299 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTAAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGAc > 2:123144/1‑299 (MQ=255) ctctcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTACCCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATACCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATAATGGATAT‑‑CTAACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTAAGGGCTGGAAAGTAAAAAAACGACACAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGGCAAGGCTTAatacgaa > 2:339459/1‑295 (MQ=255) tcACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGAt < 2:101023/299‑1 (MQ=255) aCTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGAACAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGAAA‑AGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTC‑‑AGACacaatttaaaatgaatatgaa > 2:273406/1‑280 (MQ=38) aCTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCCTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATTCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACGC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAACATGACGATGAc < 2:22588/300‑1 (MQ=255) tcctgCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTCTTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGAccc < 2:673904/296‑1 (MQ=255) ggCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGTGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGAAGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCAAGt > 1:924740/1‑300 (MQ=255) gCCAAAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACGTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGTTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCTACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTg < 2:366182/300‑1 (MQ=255) gagCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAANTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGAcctagcttcacatgaaga > 2:762032/1‑269 (MQ=255) gagCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAATGaaa > 2:872703/1‑299 (MQ=255) gTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCATCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGAAGATAAACCAGTGAACGTATATaaa > 2:152320/1‑300 (MQ=255) gTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatat < 1:301628/299‑1 (MQ=255) ttCTGACCAGGACTTTTAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATATTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATAc < 1:792815/299‑1 (MQ=255) ttCTGACCAGGACTTTGAAATCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATAc < 2:239098/299‑1 (MQ=255) ttCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATAc < 1:668816/299‑1 (MQ=255) gACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGAACCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAg < 1:962340/300‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATTCAGGTGATAAAACCAATACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTTAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGcc < 2:662725/298‑1 (MQ=255) agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCAc < 1:745620/300‑1 (MQ=255) agagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCAc < 2:111995/300‑1 (MQ=255) gagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGAACCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGTGATATATACCGCAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGATAATTCTTGCa > 1:790726/1‑288 (MQ=255) gagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTAACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAAATCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCAATGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCAGCAAGTTGAAGAAATCGATAAGTCTTGCAACGTTAGCCaat > 2:550712/1‑298 (MQ=255) cTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAAt > 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ggATAACCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAg < 2:960687/300‑1 (MQ=255) gATAATCATACAGTACATGCAGGTTAGAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTTAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTTGCTAATAg < 2:532374/299‑1 (MQ=255) tAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTAt < 2:820884/300‑1 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aaCCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCaaaa > 1:615979/1‑300 (MQ=255) aa‑aGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCATTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCNATGTTAGCCACTTGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACAcc < 2:326835/299‑1 (MQ=255) ggTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGATAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTTAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATAGACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAGATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAACTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAATTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAcc < 2:9687/300‑1 (MQ=255) ggTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAcc < 1:497797/300‑1 (MQ=255) gTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTGTATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCGAATCCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGaac < 2:924740/271‑2 (MQ=255) tttACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCctc < 2:790235/300‑1 (MQ=255) tttACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCctc < 1:123144/300‑1 (MQ=255) tttACATCAGGATTC‑‑AGACAAGGCTTAATAGGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTTGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCctc < 2:498151/300‑1 (MQ=255) aCATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGCATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGc > 2:59283/1‑300 (MQ=255) | GCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATG‑‑CGTTAGATGATGGCTAT‑‑CTCACTC‑‑CAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAA‑AGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTC‑‑GGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGC‑‑CAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGC > NC_000913/3647849‑3648444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |