| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781446 | 86 (0.710) | 12 (0.140) | 7/432 | 6.7 | 16.8% | intergenic (+2/‑131) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 781655 = | 56 (0.630) | intergenic (+3/‑430) | lysQ/nadA | tRNA‑Lys/quinolinate synthase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTTTGAGTTGAGCGCAGCGAAACA > NC_000913/781159‑781744 | cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAACATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAATTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGtt > 1:54360/1‑300 (MQ=255) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTagag < 1:839254/300‑1 (MQ=255) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTagag < 1:839433/300‑1 (MQ=255) gcggTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACTACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TTGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTagag < 1:839791/296‑1 (MQ=255) aGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCTTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCTTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGaa < 2:578807/299‑1 (MQ=255) cTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGaa > 1:178733/1‑293 (MQ=255) cTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGaa < 2:178733/293‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCANCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTNTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 2:734422/249‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACGCACGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGAACCACCAATTTAAAgg > 1:734528/1‑249 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg > 1:734422/1‑249 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGAACCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGAAACGGCCCGAAGGGCgaga > 2:629301/1‑299 (MQ=255) aCATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACAAATTTAAAGGTGGTCACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAAAGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATc > 1:121423/1‑300 (MQ=255) aTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCt > 2:411479/1‑300 (MQ=255) aaCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:792579/300‑1 (MQ=255) aaCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAACCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATTGGTCGTTAGCGTAGGTGTTAGGGTGTTTGGCGGTGGATCGATTGGTCGCAGGT‑TTAAGTCCGGCATGACCAACAAGTTTAAAGTTGGTTACG‑GGTAGAAAA‑CGT‑GG‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:491728/300‑1 (MQ=21) aaCTCAAATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:887542/300‑1 (MQ=255) ttaGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATTTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGAc < 1:225660/298‑1 (MQ=255) tCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGCTGCGCCAGCAACAGCCCGGAGGGCGAGCGAAACGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGATTAAAAATCTTGCAGTTAACACCCGGATTGGTCGTTAGTGCAGTTGGTGGGGAAGTTTACTTTGAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCATGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGAc < 2:399778/300‑1 (MQ=37) gATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGATAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAAATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCGTcc > 2:807892/1‑290 (MQ=18) gATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATcc < 1:807704/289‑1 (MQ=255) gATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATcc > 2:807704/1‑289 (MQ=255) gATGTTAAGCGTGTAGGAGAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTTAAGCGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATcc < 1:807892/290‑1 (MQ=18) gATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACcca > 2:178583/1‑300 (MQ=255) gATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATCGGCCCCGAGTAGAACCCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTCGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGAACCACAAATTTAAAGGTGGTTCCT‑GGTCGAGCA‑CGT‑GA‑AGGATAAAGTTGCGTTCGACACGGCCCAAAGGGCGAGA‑CAATGT‑CGAGCCATCTT‑GCACgcaccc > 2:389766/1‑295 (MQ=37) aTGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCTGAGGGCAAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAACCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTNTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGAc < 2:726602/296‑1 (MQ=255) tGAAGGATAACGTTTCGCCAGCAACGGTCCGTAGTGCGAGAGAAGCTAGTCATTCTACACGACCCACCACTCTTAAAGATTGGCCCCGATTAAACATCCTTCAGGTAACGCCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAAt < 2:629935/300‑1 (MQ=25) tGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGAGCTAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGNAAAAACCTTTCAGGTAACACCCGTATTGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTGATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAAt < 2:778118/300‑1 (MQ=255) tGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGTGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAAATTGGCCCCGAGTAAAAATCCTTCAGGTAACACCCGCATGGGTCGTTAGCTCAGTNGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGTTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAAt < 2:321842/300‑1 (MQ=255) aGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGa < 1:242330/299‑1 (MQ=255) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGAt > 2:402433/1‑299 (MQ=255) gATAACTTTGCGCCAACAACGTCCCTTAGGGCGAGCTAAGCGAGTCATCCTGCACGCCCCCCCCCTCTCAAAGATTGGCCCCTCGTAAAAACCCTTCAGTTAACACCCGTGTGGTTCGTTAGCTCAGTTGTTATAGTAGTTGGATTTTAATCAATTGGGTGTAGGT‑TCGAAGTCTGTATGACGCAGCAGTGTAGGGTTGGTTACT‑GGTAGAGAG‑CGG‑GA‑AGGGGAACGTTGTGTGAACAAAGGTCCTAAGGGTGAGA‑TGGAGG‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTa < 2:902805/300‑1 (MQ=255) gcGTTGCGCCAGAAACGTCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGATTCATCCTGCACGACCCACCAATTTTAGATATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGTTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACACACCAAGTGAAAGGTGGTTACG‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTGAGCAATGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgc < 2:406543/299‑1 (MQ=25) aCGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgc < 1:178583/300‑1 (MQ=255) aGCAACTGCCCTTAGGCTGAGCTAAGCGAGTCACCCTGCACTCCCCACCAATCGTAAGGATTGTCCCCTATTACAAGTCTCTCAGTCAACACCCGTATGGGTCGTCAGCTCAGTTTGTAGAGCAGTTGACTTTTAATAGATTGGTCGCAGGT‑GCGAATCCTGCAAGACCCACCAATTTAAAGTTGGTTACT‑GGTAGAAAA‑CGG‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 2:40240/300‑1 (MQ=21) aGCAACGGCCTGGAGGGCGAGCTAAGCGAGTCAGCCGGCAAGACCCACCAATCTCAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCTTATTGTTCGTTAGCTCAGTTGGGAGAGAAGGCGACTGTTAAGCAATGGGTCGCAGGG‑TCGAATTCTGCACGATCAACCAATTGGAATTTGTTGACT‑GGGGGGGAA‑CGG‑TA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 2:41089/300‑1 (MQ=255) aGCAACGGCCCTTAGTGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAACGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCATGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACTAATTTAAAGGTGGGTACG‑GGTAGGGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGGTGTGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATcc < 2:623570/300‑1 (MQ=37) aCGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa > 1:67022/1‑177 (MQ=255) cccGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAGTAAAAATCTTTCCGGTAACACCCGTCTGGGTCTTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTATT‑GGTAGAGAA‑TGT‑GG‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGCCCCACCATTCTGACTGCTTAAGGCAGCATAAtaaagcaa > 2:477032/1‑290 (MQ=25) cacGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa > 1:522216/3‑296 (MQ=255) aGTCAGCCTGCACGACCCACCAATCCTAAAGATTGGCCCTGAGTAAAACTCTTTCAGTTAACACCCATATGTGTCGTTAGCTCATTTGTTAGAGCAGTTGACGTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 2:354892/300‑1 (MQ=37) tCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTaga < 1:408033/299‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTCATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGCGAA‑CGT‑GC‑AGGATCACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGTGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACAATCCTGAATGATAAAGGCAGCATAATACAACAAGGGGTCGCTAGCTCAGTTGGTCGAGCa > 2:630478/1‑300 (MQ=37) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGc < 1:402433/299‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa > 1:163090/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCAGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa > 1:946636/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGCATCCTGCACGACCCACCAACTTAAAGGTGGTTACT‑GATAGAGAC‑CGT‑GA‑AGGATCACGTTGCGTTAGCAACGTCCCGCCGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCCCGACCCACCACCCCTAATGATGAAGGCAGAATAATCCAGAAAGGGGTTGTTGGCTCAGTTGGTAGAGCa > 2:630694/1‑300 (MQ=25) cTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGTAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TTGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa > 2:70788/1‑129 (MQ=255) cTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCAGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAtt > 2:72083/1‑298 (MQ=255) ttAAAGAGTGGCCCCGAGGAAAAAGCTTTTAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGa < 2:2434/193‑1 (MQ=255) taGTAAAAATCCTTCATGTAACACCCGTATGGGTCTTTAGCTCAGTTGTTAGAACAGTTGACTTTTAATCAATTGGNCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACCACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAt < 1:204642/297‑1 (MQ=37) gAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATcc < 1:944449/300‑1 (MQ=255) agcaaacaccTTTCCGGTAACACCCAGATGGGTCGTTAGCTCAGGTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAGTGTTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATcc < 1:493227/290‑1 (MQ=37) aGTAAAAACCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATcc < 1:944435/299‑1 (MQ=255) atcccgtcatcacccaccactcgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGGTAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAc < 1:353347/278‑1 (MQ=37) atacaaCACCCGTATGAGTCTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTACACCACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑CGTATAGAA‑CGT‑GA‑AGAATAATGTTGCGGTAACAGAGGTCTGAAGGGTG‑GAGCGG‑GTGCTGGT‑AGCTTTACATGACTCGCCATTCCGAAGGATGGAGAAGGTATAACACCTTGATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCaa < 2:653541/296‑1 (MQ=9) ggTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAt > 1:58506/1‑300 (MQ=255) gtcacccccccccgggTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGTGCGAGA‑CGa < 2:3069/148‑1 (MQ=21) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTCAGAGTAGCTACT‑TGTAAAGAC‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGTGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCGTCCT‑GCACGAACCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCAGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCaa > 1:653541/1‑294 (MQ=37) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑NGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCNACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTa > 2:739261/1‑298 (MQ=255) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGt > 2:926589/1‑297 (MQ=255) cccGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑AGTAGAGAC‑CGT‑GC‑AGGATACCGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCAAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTCAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGTAGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaa > 2:488922/1‑297 (MQ=37) cGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGATCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaaa > 1:919799/1‑299 (MQ=255) gTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaa < 1:621540/297‑1 (MQ=255) gggTCGTTAACTCAGTTGGGAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCTAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGAc < 2:375385/169‑1 (MQ=255) ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAgg < 1:53894/300‑1 (MQ=255) aGCTCAGTCGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATTAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCACAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTCGAGCAGTTGACTTTTACTCAATCGGTCGCAGGTTCGAATCCTGAACGACCCACCAATGTAAAAGAGCGCACCAAAGgc > 1:951408/1‑299 (MQ=37) gcttaGTTGGTAAAGCAGTTGCCTCTTAATCAATTGGTAGTCGGTGTAGA‑TCTTGCACGACCCACCACTTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGt < 1:453783/109‑1 (MQ=255) aGTTGTTAGAGCAGTTGACTTGTAATCAATTGGGCACAGAT‑TCGAAGCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAG‑TGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCTAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 2:354879/217‑1 (MQ=37) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCTCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAACAAAGCGCCATGAAGGCGCtttt > 2:784602/1‑300 (MQ=255) gagagCAATTTACTTTTAATCGATAGTACGCGGGT‑TCGGATCCTGCACGAACCACAAGTTTAAAGGTGGTTAAT‑GTTGGCG‑‑‑GGTAGACAGGAGAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:450219/146‑1 (MQ=2) agCAGTTGACTTTTAATCAATCGGTCGCAGGT‑TCGAACCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑TTT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCTATA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAgg < 2:125098/284‑1 (MQ=255) gTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAAtttcaaagt > 2:140786/1‑54 (MQ=11) gTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAAtttcaa > 2:423552/1‑54 (MQ=16) gACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGGAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATAc < 1:659799/300‑1 (MQ=255) aTTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAC‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGACGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCACCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTATCTCAGTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCCATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGa > 2:193082/1‑300 (MQ=255) aTTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGCGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCATTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCAACAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTTGCGATCCTCACAGATTCGa > 2:156159/1‑300 (MQ=38) aTTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAACGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGa > 2:192016/1‑300 (MQ=255) ggttgCAGGT‑TTGAATCCGGCATGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:781004/118‑1 (MQ=25) t‑tCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:887535/113‑1 (MQ=255) t‑tCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc > 2:887535/1‑113 (MQ=255) t‑tCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTgcagca > 1:50002/1‑298 (MQ=255) tGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTttgagt < 1:739261/298‑1 (MQ=255) gCACGCCCCACCAGTTTAAAGGTGGGTACG‑GGTAGGGAG‑CGT‑GG‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATcc < 2:133994/115‑1 (MQ=18) gCACGACCAACCAATTTAAAGGTGGTTACG‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATcc < 2:133336/115‑1 (MQ=255) aTTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGCCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGAAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCACTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTTTGAGTTGAGCGCAGCGAaaca > 1:886511/1‑300 (MQ=255) tttAAAGGTGGGTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCAc < 1:140786/89‑1 (MQ=255) | CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGT‑TCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGT‑GA‑AGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGA‑CGAAGT‑CGAGTCATCCT‑GCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTTTGAGTTGAGCGCAGCGAAACA > NC_000913/781159‑781744 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |