| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_012971 | 753,860 | A→G | pseudogene (144/921 nt) | ECD_RS03715 ← | phage integrase Arm DNA‑binding domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_012971 | 753,860 | 0 | A | G | 98.2% | 401.6 / NA | 113 | pseudogene (144/921 nt) | ECD_RS03715 | phage integrase Arm DNA‑binding domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (57/54); minor base T (0/2); total (57/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.43e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTT > NC_012971/753565‑754155 | gtgtTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGCCCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAGCGTAACGNAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATGGCtt > 1:587958/1‑300 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GTGTTGATCTGATTAACTTGGCTGACGCCGCCTTGCCCTCGTCTATGTATCCATTGAGCATTGCCGCAATTTCTTTTGTGGTGATGTCTTCAAGTGGAGCATCAGGCAGACCCCTCCTTATTGCTTTAATTTTGCTCATGTAATTTATGAGTGTCTTCTGCTTGATTCCTCTGCTGGCCAGGATTTTTTCGTAGCGATCAAGCCATGAATGTAACGTAACGGAATTATCACTGTTGATTCTCGCTGTCAGAGGCTTGTGTTTGTGTCCTGAAAATAACTCAATGTTGGCCTGTATAGCTTCAGTGATTGCGATTCGCCTGTCTCTGCCTAATCCAAACTCTTTACCCGTCCTTGGGTCCCTGTAGCAGTAATATCCATTGTTTCTTATATAAAGGTTAGGGGGTAAATCCCGGCGCTCATGACTTCGCCTTCTTCCCATTTCTGATCCTCTTCAAAAGGCCACCTGTTACTGGTCGATTTAAGTCAACCTTTACCGCTGATTCGTGGAACAGATACTCTCTTCCATCCTTAACCGGAGGTGGGAATATCCTGCATTCCCGAACCCATCGACGAACTGTTTCAAGGCTTCTT > NC_012971/753565‑754155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |