| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 739785 | 84 (0.830) | 11 (0.150) | 10/438 | 4.7 | 16.0% | noncoding (76/76 nt) | ECD_RS03640 | tRNA‑Lys |
| ? | NC_012971 | 740008 = | 53 (0.710) | intergenic (+1/‑132) | ECD_RS03645/ECD_RS03650 | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTACGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAGCCACCAATTTTAAAGATTGGTTCCGAGTAGAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAC > NC_012971/739488‑740077 | gTCATCACCCACCACCGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAg < 1:110992/299‑1 (MQ=255) acccaccACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTCATCCCGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGCAGTCTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTNCCTTACAAGGGGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCCGTTTTa > 2:250395/1‑298 (MQ=25) acccaccACCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATCACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTGGTAGTACCCAGCGCATTATCAGGTGATTAGCTACGCTGGGAGATCACCTCCCTTCCCAGGAGGGGATCGGCGGTCCGATCCCGTCATCACCCACCACTCAGGTCGTTAGCTCCGTTGGTCGTGCCGTCGACTTTTCATCAATTGGTCGCAGGTTTGAACCCTGCACGAACCAACAGTTTTAAc > 2:370467/1‑300 (MQ=25) accaccTGGTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGTGATTTTTGATTAATTGGTTGCAGGTCTGGATCTCGCACGACCCGCCACTAATTACGGTTGGTGCGGTGGAAGGGGTGTGTAATACCCAACGCAGTATTGGGGTATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACCAGGGGGGGGTTGGTGGTTTGATCCCGGCATCACCCACCAATCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACa < 1:197108/297‑1 (MQ=12) ccaccGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTACTCACGTTGTGCTCGGTAGAAACAGTTTATAGTCCCCATTGCATTATCGAATGCTTAGCTCATATGTGCGGGCACCTCTATTAAAAGGAGGGTGTCGGCGGTTGGTTTCTGTTATCGATCACTATTCGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGTAGTTGACTTTTACTCGATTGGTCGCCGGTTCGAATCCTGCCCGACCCACTAGTTTTAATATCaa > 2:138166/1‑300 (MQ=12) cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTCGAGCAGTTGACTTTTAACCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGGACGACCCACCAAtttaaaggtggttgctggtagagaaagt > 2:184159/1‑274 (MQ=21) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATCCTCACGTTAGGCTCGGTGGAAAGAGTTTATAATACCCCTCGCAGCGTCGGGTGCTTGTCTCCGCTGGGAGAGTACCCCCCTTACACGGAGAGGATAGGCAGTTCGATCTTGTCTTCACCCACCCCTCGGGTGGTTAGCTCAGGTGGTAGGGCAGGTGACTTGTAATGAATTGGTCGCAGGTTCGAATGATGCATGACCAACCAGTTTTAAGATCGAAATAAGATGTTaggtgt > 2:353615/1‑294 (MQ=12) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |