| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,927,946 | 2 bp→GT | coding (792‑793/993 nt) | asnA → | asparagine synthetase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,927,946 | 0 | A | G | 100.0% | 279.0 / NA | 74 | Q264Q (CAA→CAG) | asnA | asparagine synthetase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (23/51); total (23/51) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 3,927,947 | 0 | C | T | 98.7% | 253.8 / NA | 74 | L265L (CTG→TTG) | asnA | asparagine synthetase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (23/50); minor base G (0/1); total (23/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCGTACACAGCCAGGAGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAAGGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGCGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCGGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCCTCCATGGGGATCCGTGTAGATGCCGACACGCTGAAGCATCAACTGGCGCTGACCGGTGACGAAGATCGCCTGGAGCTGGAGTGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGATATGATCGAAAATGCGCATGATGCCGGGTT > NC_000913/3927654‑3928237 || tCGTACACAGCCATGAGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGgcgc < 1:456438/300‑1 (MQ=255) gCCAGGAGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGt > 2:759713/1‑299 (MQ=255) atgAGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGa < 1:71144/296‑1 (MQ=255) aGGAGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGa < 1:71177/298‑1 (MQ=255) aGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCTTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCNTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGGTGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAg < 1:599582/300‑1 (MQ=255) aGTTACTGTCTCGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAg < 1:736706/300‑1 (MQ=255) ctcGTTATCCGGATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTAACCGGTGATGAAGATCGTctgc > 2:202224/1‑299 (MQ=255) gATCTTGATGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTctgcagctggaat > 2:542984/1‑296 (MQ=255) ttGATGCCAAATTGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCAt < 2:807597/299‑1 (MQ=255) tGCCAAATGGCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGgc < 1:72820/300‑1 (MQ=255) aatggCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCgctgc < 1:63898/297‑1 (MQ=255) tggCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTTAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGctgctg < 1:322653/299‑1 (MQ=255) tggCGTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGctgctg < 1:323409/299‑1 (MQ=255) gTGAGCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTgcgc < 1:339626/299‑1 (MQ=255) gCGGGCGATAGCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGGCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGa > 2:557349/1‑300 (MQ=255) gCGAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGNTGCGTTTGAGTTTTCTTACATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCa > 2:253369/1‑299 (MQ=255) gAAAGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGAc < 1:639639/300‑1 (MQ=255) aaaGATCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGAcc < 2:543196/300‑1 (MQ=255) tCTTGGTGCGGTATTCCTTGTCGGGATTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATcgg < 1:236456/300‑1 (MQ=255) 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aTTGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGttt < 2:523454/299‑1 (MQ=255) tGGCGGCAAGCTGAGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCACACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCAGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGAc < 1:432384/300‑1 (MQ=255) ggcggcAAGCTGAGCGANGGTCATCGCCACGACGTGNGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGNCCAGTCTCGTTTGAcc < 1:687029/300‑2 (MQ=255) aGCGATGGTCATCGCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCAtgctgctgctg < 1:662489/300‑1 (MQ=255) gCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGNAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCNCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATTGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATAGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCata > 2:611271/1‑300 (MQ=255) gCCACGACGTGCGCGCACCGGATTATGATGACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCat < 1:759713/299‑1 (MQ=255) 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atgatgACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGTGTAt < 1:636400/300‑1 (MQ=255) atgatgACTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGTGTAt > 2:813655/1‑300 (MQ=255) atgatgAATGGAGCACCCCGTCAGAGTTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTACATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTAGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCACATATCGGCAAGGTTCAGTGTggtgtct > 2:813756/1‑295 (MQ=255) 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atgaCTGGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGTGTATGGc < 1:103359/300‑1 (MQ=255) tgaCTTGAGCACCCCGTCAGAGCTGGGCCATGCGGGTCTGAACGGCGATATTCTGGTGTGGAACCCTGTACTGGAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGTGTATGGcc < 1:218564/300‑1 (MQ=255) tgaCTGGAGCACCCCTTCAGAGTTGTGCTATGCTGGTCTGAGCGGCGGTGTTCTGGTGTGGAATCCTGTACTGTAAGATGCGTTTGAGCTTTCTTCCATGGGGATCCGCGTGGATGCCGACACGTTGAAGCATCAGTTGGCGCTGACCGGTGATGAAGATCGTCTGCAGCTGGAATGGCATCAGGCGCTGCTGCGCGGTGAAATGCCGCAGACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACCATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGTGTATGGcc < 2:502076/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |