| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 113,438 | C→T | intergenic (+150/‑6) | yacM → / → guaC | protein YacM/GMP reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 113,438 | 0 | C | T | 99.1% | 355.6 / ‑6.1 | 109 | intergenic (+150/‑6) | yacM/guaC | protein YacM/GMP reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (51/57); total (52/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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ccccAGGAATTCGCACATGCGTATTGAAGAAGATCTGAAGTTAGGTTTTAAAGACGTTCTCATCCGCCCTAAACGCTCCACTCTTAAAAGCCGTTCCGATGTTGAACTGGAACGTCAATTCACCTTCAAACATTCAGGTCAGAGCTGGTCCGGCGTGCCGATTATCGCCGCAAATATGGACACCGTAGGCACATTTTCTATGGCCTCTGCGCTGGCTTCTTTTGATATTTTGACTGCTGTGCATAAACACTATTCTGTCGAAGAGTGGCAAGCGTTTATCAACAATTCTTACGCTGAtgt > 1:442127/1‑300 (MQ=255) aGGAATTCGCACATGCGTATTGAAGAAGATCTGAAGTTAGGTTTTAAAGACGTTCTCATCCGCCCTAAACGCTCCACTNTTAAAAGCCGTTCCGATGTTGAACTGGAACGTCAATTCACCTTCAAACATTCAGGTCAGAGCTGGTCCGGCGTGCCGATTATCGCCGCAAATATGGACACCGTAGGCACATTTTCTATGGCCTCTGCGCTGGCTTCTTTTGATATTTTGACTGCTGTGCATAAACACTATTCTGTCGAAGAGTGGCAAGCGTTTATCAACAATTCTTCCGCTGATGTGCTg < 1:160775/300‑1 (MQ=255) | GCAAACGCATTGGCAACGGTACTCTTGCCACTGCCAATGCCTCCCGTTAAGGCAACTATATACCTCATAATTTATATTCCCGGGAATTCATCATGATTATCAAAACGTTAAAAATGAGTGCACGAAAGCGAAATTGATGAAACGTTCGCTCACTATTTACCAGGTAAATTTATGGGATTGTAGCGTAAAAAAAGACAATTTCGCAGTCTTGCGCCGCATTGATTAGTGCGTATGATAGCGTCACTGGAGTTGCGCTCTTACCCTTATAGCCATTAACCCCAGGAATCCGCACATGCGTATTGAAGAAGATCTGAAGTTAGGTTTTAAAGACGTTCTCATCCGCCCTAAACGCTCCACTCTTAAAAGCCGTTCCGATGTTGAACTGGAACGTCAATTCACCTTCAAACATTCAGGTCAGAGCTGGTCCGGCGTGCCGATTATCGCCGCAAATATGGACACCGTAGGCACATTTTCTATGGCCTCTGCGCTGGCTTCTTTTGATATTTTGACTGCTGTGCATAAACACTATTCTGTCGAAGAGTGGCAAGCGTTTATCAACAATTCTTCCGCTGATGTGCTG > NC_000913/113152‑113731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |