| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,656,167 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+18/‑13) | ynfB → / → speG | DUF1283 domain‑containing protein YnfB/spermidine N‑acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 79 (0.810) | 50/584 | 0.6 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1656171 | 0 (0.000) | intergenic (+22/‑13) | ynfB/speG | DUF1283 domain‑containing protein YnfB/spermidine N‑acetyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 26 (0.270) | 16/586 | 4.4 | 92.7% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1656167 = | 2 (0.020) | intergenic (+18/‑17) | ynfB/speG | DUF1283 domain‑containing protein YnfB/spermidine N‑acetyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGTAAGGACACGTTATGCCAAGCGCCCACAGTGTTAAGCTACGCCCGCTGGAGCGTGAAGATTTACGCTATGTACATCAACTCGACAATAACGCCAGTGTGATGCGTTACTGGTTTGAGGAACCCTACGAAGCCTTTGTTGAACTCTCTGATCTGTATGATAAGCATATTCACGATCAGAGCGAACGGCGCTTTGTGGTGGAATGTGACGGCGAAAAAGCCGGTCTGGTGGAGCTGGTGGAAATTAACCATGTTCATCGCCGCGCAGAATTTCAGATAATTATCTCC > NC_000913/1655873‑1656456 | gAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGt > 1:413647/1‑300 (MQ=255)gAGCACAACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCATACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGt > 1:413555/1‑300 (MQ=255) caACTGTTCATGCCGAAACTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatt < 1:490117‑M2/300‑7 (MQ=255) aaCTAACAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttcca < 1:602273‑M2/300‑23 (MQ=255) aaCAAACTGGTGATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagaca > 1:627378‑M2/1‑274 (MQ=255) gATTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 1:440511‑M2/1‑263 (MQ=255) aTTGAGTCTGGCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact > 1:299632‑M2/1‑262 (MQ=255) tGGCGACAGTGAACAAAGCCGCCAGCACCGCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc > 2:675707‑M2/1‑255 (MQ=255) ggCGACAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGTCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTCAGGAATGtggatttgcccctatctttccagacatctgttatcacttaaaccatt < 1:548785‑M2/300‑48 (MQ=255) aCAGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 2:403138‑M2/299‑51 (MQ=255) aGTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag > 1:42391‑M2/1‑247 (MQ=255) gTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGTAGCCCAATGCTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctcttatcacttaacccattacaagcc > 2:401725‑M2/1‑246 (MQ=255) gTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcc > 2:549933‑M2/1‑246 (MQ=255) gTGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcc < 1:16420‑M2/300‑55 (MQ=255) tGCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac > 1:134278‑M2/1‑245 (MQ=255) gCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTCCCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc < 1:105853‑M2/299‑56 (MQ=255) gCACAAAGCCGCCAGCAC‑GCAGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCACAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc < 1:105623‑M2/299‑56 (MQ=255) acaAAGCCGCCAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTTGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgc > 1:497890‑M2/1‑242 (MQ=255) cAGCAC‑GCCGCTATGGAAAAAGAGCAATGGAATGACACGCGCAATCTGCGCCAGAAAGTGAATAAACGCACTGAAAAAGAGTGGGATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagata < 1:116568‑M2/300‑69 (MQ=255) 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ggATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCACAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcaattcgttataatgctcgaacgcctatgcaaggttctttgct < 2:360291‑M2/299‑151 (MQ=255) gATAAAGCCGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaatgcctctgcaaggttctttgctgc < 2:33573‑M2/300‑153 (MQ=255) acgccGACGCCGCTTTTGATAACCGCGATAAATGTGAGCAAAGCGCCAACATCAATGCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgtt < 1:83462‑M2/298‑157 (MQ=255) 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(MQ=255) gCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagc > 1:348604‑M2/1‑88 (MQ=255) gCCTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagc > 1:348463‑M2/1‑88 (MQ=255) ccTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatg > 1:400230‑M2/1‑87 (MQ=255) ccTACTGGGAGCCCAATACTTTGCGCTGCCTGGACCGTCGAACTGGCCGCGTTATTACCCCCTAACCTGTTATTGATTTAAGGAATGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatg < 2:400230‑M2/273‑187 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |