| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 3,959,446 | 55 bp→TAGCGATTCAGAGT | intergenic (+1/+32) | ilvC → / ← ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3959446 | 3959500 | 55 | 71 [0] | [0] 74 | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3959445 | 0 (0.000) | 66 (0.710) +TAGCGATTCAGAGT |
46/558 | 0.7 | 100% | coding (1476/1476 nt) | ilvC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+)) |
| ? | NC_000913 | 3959501 = | 0 (0.000) | intergenic (+56/+31) | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C | |||||
TGCCGCTGATTGCCAACACCATCGCCCGTAAGCGTCTGTACGAAATGAACGTGGTTATCTCTGATACCGCTGAGTACGGTAACTATCTGTTCTCTTACGCTTGTGTGCCGTTGCTGAAACCGTTTATGGCAGAGCTGCAACCGGGCGACCTGGGTAAAGCTATTCCGGAAGGCGCGGTAGATAACGGGCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCGGAATTCACCTAAATCACCGCCGCGTTTGCCTGATGGGCAAATGGAGTGTTTCTTCGCCAGCTTGCCGAAATCGGCCCCGTTCTTAATC > NC_000913/3959150‑3959742 | tGCCGCTGATTGCCAACACCATCGCCCGTAAGCGTCTGTACGAAATGAACGTGGTTATCTCTGATACCGCCGAGTACGGTAACTATCTGTTCTCTTACGCTTGTGTGCCGCTGCTGAAACCGTTTATGGCAGAGCTGCAACCGGGCGACCTGGGTAAAGCTATTCCGGAAGGCGCGGTAGATAACGGGCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAtag < 1:542824‑M1/299‑4 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |