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TGTTCGCACCTTCCCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATACACAAGAAATAACACTCTTTTTATCGTTAAAAAATGATATTTCACTTTGCCCATGCCGTTAAAGTCACTGATAATGCGTCCGTTCGTAAATTCAAAATGGCGTAATCTAATATATGCTAAATTTATTTGTTGGCCTTGATATATACACAGGGCTTTTGTTATTGCTTGCTCTGNCATTTGTGTTGTTCTACGAAGCAATCAATGGTTTTCATGACACGGCGAATGCGGTGGCAGCCGTTATTTATACTCGT > 1:163077/1‑299 GTTCGCACCTTCCCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATACACAAGAAATAACACTCTTTTTATCGTTAAAAAATGATATTTCACTTTGCCCATGCCGTTAAAGTCACTGATAATGCGTCCGTTCGTAGATTCAAAATGGCGTAATCTAATATATGCTAAATTTATTTGTTGGCCTTGATATATACACAGGGCTTTTGTTATTGCTTGCTCTGGCATTTGTGTTGTTCTACGAAGCAATCAATGGTTTTCATGACACGGCGAATGCGGTGGCAGCCGTTATTTATACTCGTGC > 2:558614/1‑300 TCGCACCTTCCCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATACACAAGAAATAACACTCTCTTTATCGTTAAAAAATGATATTTCACTTTGCCCATGCCGTTAAAGTCACTGATAATGCGTCCGTTCGTAAATTCAAAATGGCGTAATCTAATATATGCTAAATTTATTTGTTGGCCTTGATATATACACAGGGCTTTTGTTATTGCTTGCTCTGGCATTTGTGTTGTTCTACGAAGCAATCAATGGTTTTCATGACACGGCGAATGCGGTGGCAGCCGTTATTTATACTCGTGCCA < 2:36481/300‑1 GCACCTTCCCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATACACAAGAAATAACACTCTTTTTATCGTTAAAAAATNATATTTCACTTTGCCCATGCCGTTAAAGTCACTGATAATGCGTCCGTTCGTAAATTCAAAATGGCGTAATCTAATATATGCTAAATTTATTTGTTGGCCTTGATATATACACAGGGCTTTTGTTATTGCTTGCTCTGGCATTTGTGTTGTTCTACGAAGCAATCAATGGTTTTCATGACACGGCGAATGCGGTGGCAGCCGTTATTTATACTCGTGCCATG < 1:170925/300‑1 TCCCTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATACACAAGAAATAACACTCTTTTTATCGTTAAAAAATGATATTTCACTTTGCCCATGCCGTTAAAGTCACTGATAATGCGTCCGTTCGTAAATTCAAAATGGCGTAATCTAATATATGCTAAATTTATTTGTTGGCCTTGATATATACACAGGGCTTTTGTTATTGCTTGCTCTGGCATTTGTGTTGTTCTACGAAGCAATCAATGGTTTTCATGACACGGCGAATGCGGTGGCAGCCGTTATTTATACTCGTGCCATGCAACCA > 1:212336/1‑300 GCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3130438‑3130146‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAAAGGTTTTGAATGAATGCTTATTGTCTGATACACAAGAAATAACACTCTTTTTATCGTTAAAAAATGATATTTCACTTTGCCCATGCCGTTAAAGTCACTGATAATGCGTCCGTTCGTAAATTCAAAATGGCGTAATCTAATATATGCTAAATTTATTTGTTGGCCTTGATATATACACAGGGCTTTTGTTATTGCTTGCTCTGGCATTTGTGTTGTTCTACGAAGCAATCAATGGTTTTCATGACACGGCGAATGCGGTGGCAGCCGTTATTTATACTCGTGCCATGCAACCAC < NC_000913/3136518‑3136221 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |