| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CATTTATGTTTATGGCGGACCTGTGCCGTGAAGTTCAGGTATCTCATGAAGTCGACTTTATGACCGCCTCCAGCTACGGTAGCGGCATGTCCACCACCCGTGATGTGAAAATCCTCAAAGATCTGGATGAAGATATCCGTGGCAAGGACGTGCTGATTGTTGAAGATATCATCGACTCGGGGAATACACTGTCGAAAGTGCGTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAAT > NC_000913/141564‑142145 | cATTTATGTTTATGGCGGACCTGTGCCGTGAAGTTCAGGTATCTCATGAAGTCGACTTTATGACCGCCTCCAGCTACGGTAGCGGCATGTCCACCACCCGTGATGTGAAAATCCTCAAAGATCTGGATGAAGATATCCGTGGCAAGGACGTGCTGATTGTTGAAGATATCATCGACTCGGGGAATACACTGTCGAAAGTGCGTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCAGGTAGAATTTATc > 2:671563/1‑299 (MQ=255) 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aaCCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCAGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTAGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCagtcgt > 2:61966/1‑299 (MQ=255) gtcccgtcGTGAAGTGAACGTCCCGTTAGAATTCACCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCATCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAAt < 2:85403/299‑1 (MQ=255) gtcgtGAAGTGAACGTCCAGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGTCGTa > 2:3737/1‑300 (MQ=255) 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CATTTATGTTTATGGCGGACCTGTGCCGTGAAGTTCAGGTATCTCATGAAGTCGACTTTATGACCGCCTCCAGCTACGGTAGCGGCATGTCCACCACCCGTGATGTGAAAATCCTCAAAGATCTGGATGAAGATATCCGTGGCAAGGACGTGCTGATTGTTGAAGATATCATCGACTCGGGGAATACACTGTCGAAAGTGCGTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAAT > NC_000913/141564‑142145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |