| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3647886 | 99 (1.020) | 6 (0.070) | 6/540 | 7.3 | 6.3% | intergenic (‑98/‑177) | dinQ/agrA | membrane toxin DinQ/small RNA AgrA |
| ? | NC_000913 | 3648317 = | 88 (0.990) | noncoding (24/82 nt) | agrB | small regulatory RNA AgrB | |||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACC‑CAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAA‑TTCACA‑CCTATTACCTTCCTCTGC‑A‑CTTACACATT‑CGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGCAACAATCAGGAGCGCAATATGTCATTTCTGTTACCCATCCAATTGTTCAAAATTCTTGCTGATGAAACCCGTCTGGGCATCGTTTTACTGCTCAGCGA > NC_000913/3648021‑3648607 | aCGTCTTTGCAATAGTTTCTGTATGGTATTAGAATTGATGCGTTAGATGAGGGCTATCTCACGCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCTACGCAAATTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACC‑CAGTGAAATGATATAAGTCGTAACTGCGATATATACCTAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATCCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTccagc < 2:15459/299‑1 (MQ=255) 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tcACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAA‑TTCACA‑CCTATTACCTTCCTCTGC‑A‑CTTACACATT‑CGTTAAGTCATATATGGTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGCAACAATCAGGAGCGCAATATGTCATTTCTGTTACCCATCCAATTGTTCAAAATTCTTGCTGATGAAACCCGTCTGGGCATCGTTTTACTGCTCAGCGa < 2:681288/298‑1 (MQ=255) | ACGTCCTTGCAATAGTTTCAGTATGGTATTAGCATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACC‑CAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAA‑TTCACA‑CCTATTACCTTCCTCTGC‑A‑CTTACACATT‑CGTTAAGTCATATATGTTTTTGACTTATCCGCTTCGAAGAGAGACACTACCTGCAACAATCAGGAGCGCAATATGTCATTTCTGTTACCCATCCAATTGTTCAAAATTCTTGCTGATGAAACCCGTCTGGGCATCGTTTTACTGCTCAGCGA > NC_000913/3648021‑3648607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |