| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,493,432 | 0 | G | C | 42.1% | 16.8 / 50.7 | 38 | intergenic (‑178/+335) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase/protein YfdX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/14); new base C (4/12); total (12/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.09e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGACGTTCAATTTTAATAACGTCAGCGC‑C‑AAACCAGGCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTATAAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGA > NC_000913/2493138‑2493726 | gggACGTTCAATTTTAATAACGTCAGCGC‑C‑AAACCAGGCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTATAAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTACTGatg < 1:537358/300‑3 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GGGACGTTCAATTTTAATAACGTCAGCGC‑C‑AAACCAGGCCAGCATTTGAGTACAAGATGGGCCAGATTGCACACCGGTGAAATCGAGAACTTTAATTCCTTGAAGTGGAGTTGACATAGCAATACCTATTAGTTAATTAAATATGTGTTAATTTAGCGTTTATTTAAGGCGTAATATCTTCTATAAATAACCCGCAAAATATCGTCGTAGCTGCACTCGATATTTTTAAAATCCTGTATCAAGTGCTGAAAATCATTTCATCGCCACTTCCAATTCCTTTCTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAAAAATTGTCGGCTGGA > NC_000913/2493138‑2493726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |