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Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
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tctcATGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCAGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCGCAGCAgggg < 1:204472/300‑1 (MQ=255) tctcAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCAGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCgcagca > 2:24311/1‑296 (MQ=255) tctcAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCAGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCgcagca > 1:91144/1‑296 (MQ=255) | GCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCTATGATTTAAGTGAAGAAAAGTTGATGAAACTGAAGTATAAATCACAACATGGTGATTCAGAGGCATCATTTCGACTATATCAATATTACTGCTTTACTAAAAATAACATTTACAAACAATTGCGATTCTTGGAAAGATCAGCATCTCAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTATAATTTGAATAGAGCTATTTATTGGATGGAATTCGCTGTAAATAACGGTAATATTGATGCAAAGAGCAAACTTCAAGAGCTCAAAAAGCTAAAGCGAATGGATAGAAGGAAGAATAAGGAGAATCCGTAAAAGCAATAGTTCATCAGACTGCCGCAGCAGTAGTATGATGATGAATCAGGGCTGTACTATAACTATTATCGGTAACATTAACCGCAGCAGGGG > NC_000913/3768138‑3768731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |