| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,866,301 | 0 | A | G | 99.3% | 493.6 / ‑4.5 | 138 | intergenic (‑28/+168) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (74/61); total (76/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GCAATGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGCGCCAGAG > NC_000913/3866015‑3866583 | gcAATGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTGATTGCTACgaat < 2:431189/299‑4 (MQ=255) 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tttCTCTTGAGATAACATTTTGATTGCTACGAATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCTGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGCGcc < 2:160895/300‑1 (MQ=255) tctTGAGATAACATTTTNATTGCTACGAATTATGGCNGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTANGAAGGTTGCGCCagag < 1:616908/300‑1 (MQ=255) tctTGAGATAACATTTTGATTGCTACGAATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGCGCCagag < 1:675341/300‑1 (MQ=255) | GCAATGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGCGCCAGAG > NC_000913/3866015‑3866583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |