| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,769,744 | T→C | intergenic (+64/+499) | yibV → / ← yibH | PF15596 family protein YibV/inner membrane protein YibH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,769,744 | 0 | T | C | 98.0% | 484.6 / NA | 146 | intergenic (+64/+499) | yibV/yibH | PF15596 family protein YibV/inner membrane protein YibH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/0); new base C (79/64); total (82/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCCATCATCGCAATAGATGGAAAAGCACTCCTGCTCTTTTTTGATTAGAGCCGTCGCAGGAGGAAC > NC_000913/3769458‑3770037 | ggCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAGGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCAGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAACAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGACCATtgat > 2:324241/1‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |