| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,233,609 | C→T | Q4* (CAG→TAG) | yeiS → | DUF2542 domain‑containing protein YeiS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,233,609 | 0 | C | T | 99.1% | 400.3 / NA | 109 | Q4* (CAG→TAG) | yeiS | DUF2542 domain‑containing protein YeiS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (69/39); minor base G (0/1); total (69/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTCCCTATTCCGGCTATGCACCAGGTACCGGAAGATGCGCAGGGGTATCCCGCCGTCACACCCGAACAGTTACTTGAATTACAAAAGAAACAAGGAAAGTAGTTATGGATGTACAGCAGTTTTTTGTCGTTGCCGTTTTTTTCCTTATCCCGATATTTTGTTTCCGCGAAGCATGGAAAGGCTGGCGCGCAGGCGCGATTGATAAACGGGTTAAAAATGCACCGGAACCGGTGTATGTCTGGCGAGCAAAAAATCCCGGACTCTTTTTCGCTTATATGGTGGCATATATCGGCTTCGGAATTTTATCTATCGGCATGATTGTTTATCTTATTTTCTATCGTTAATATTCCCCTCTCCAGTTAATTATTGAGAATAATTATTACTTCACCTGATAAGCTGCGGATATCAC > NC_000913/2233316‑2233904 | cGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTCCCTATTCCGGCTATGCACCAGGTACCGGAAGATGCGCAGGGGTATCCCGCCGTCACACCCGAACAGTTACTTGAATTACAAAAGAAACAAGGAAAGTAGTTATGGATGTATAGCAGt > 1:702542/1‑300 (MQ=255) 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aTGTATAGCAGTTTTTTGTCGTTGCCGTTTTTTTCCTTATCCCGATATTTTGTTTCCGCGAAGCATGGAAAGGCTGGCGCGCAGGCGCGATTGATAAACGGGTTAAAAATGCACCGGAACCGGTGTATGTCTGGCGAGCAAAAAATCCAGGACTCTTTTTCGCTTATATGGTGGCATATATCGGCTTCGGAATTTTATCTATCGGCATGATTGTTTATCTTATTTTCTATCGTTAATATTCCCCTCTCCAGTTAATTATTGAAACTAATTATTACTTCACCTGATAAGCTGCGGATATca > 2:123374/1‑300 (MQ=255) aTGTATAGCAGTTTTTTGTCGTTGCCGTTTTTTTCCTTATCCCGATATTTTGTTTACGCGAAGCATGGAAAGGCTGGCGCGCAGGCGCGATTGATAAACGGGTTAAAAATGCACCGGAACCGGTGTATGTCTGGCGAGCAAAAAATCCCGGACTCTTTTTCGCTTATATGGTGGCATATATCGGCTTCGGAATTTTATCTATCGGCATGATTGTTTATCTTATTTTCTATCGTTAATATTCCCCTCTCCAGTTAATTATTGAGAGTAATTATTACTTCACCTGATAAACTGCGGATATca > 2:402777/1‑300 (MQ=255) tGTATAGCAGTTTTTTGTCGTTGCCGTTTTTTTCCTTATCCCGATATTTTGTTTCCGCGAAGCATGGAAAGGCTGGCGCGCAGGCGCGATTGATAAACGGGTTAAAAATGCACCGGAACCGGTGTATGTCTGGCGAGCAAAAAATCCCGGACTCTTTTTCGCTTATATGGTGGCATATATCGGCTTCGGAATTTTATCTATCGGCATGATTGTTTATCTTATTTTCTATCGTTAATATTCCCCTCTCCAGTTAATTATTGAGAATAATTATTACTTCACCTGATAAGCTGCGGATATcac < 1:684753/300‑1 (MQ=255) | CGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGTCACCGAAAGATATGCTGTCAGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTCCCTATTCCGGCTATGCACCAGGTACCGGAAGATGCGCAGGGGTATCCCGCCGTCACACCCGAACAGTTACTTGAATTACAAAAGAAACAAGGAAAGTAGTTATGGATGTACAGCAGTTTTTTGTCGTTGCCGTTTTTTTCCTTATCCCGATATTTTGTTTCCGCGAAGCATGGAAAGGCTGGCGCGCAGGCGCGATTGATAAACGGGTTAAAAATGCACCGGAACCGGTGTATGTCTGGCGAGCAAAAAATCCCGGACTCTTTTTCGCTTATATGGTGGCATATATCGGCTTCGGAATTTTATCTATCGGCATGATTGTTTATCTTATTTTCTATCGTTAATATTCCCCTCTCCAGTTAATTATTGAGAATAATTATTACTTCACCTGATAAGCTGCGGATATCAC > NC_000913/2233316‑2233904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |