| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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| ? | NC_000913 | 2042477 = | 123 (1.350) | coding (110/531 nt) | yodB | putative cytochrome b561 YodB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTACTTATCTGCTGATGCGAGAAACACATTACAATGCGGGTATATTCGTTTGGGTGTTAATGTTTTCACGCCTGATTATAAAACACCGTTATAGTGATCCTTCTATTGTGCCACCGCCACCTGCCTGGCAAATGAAAGCGGCTTCGCTAATGCACATCATGCTTTATATAACCTTCCTTGCACTTCCTCTGCTGGGGATTGCTTTGATGGCTTACAGTGGAAAATCGTGGAGTTTCCTTGGTTTCAATGTGTCTCCCTTTGTTACCCCAAACAGCGAAATTAAAGCACTGATAAAAAATA > NC_000913/2042180‑2042776 | aaTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGgtagtagt < 2:388896/299‑1 (MQ=255)aaTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGgtagtagt < 1:124292/299‑1 (MQ=255) aTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCNAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCAGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGgtagtagtt > 2:585536/1‑298 (MQ=255) aTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTAc < 1:243058/300‑1 (MQ=255) aTAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGAATGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTCAAGgtcgtagtt > 2:209070/1‑298 (MQ=255) ggATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGNACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTACTTATc < 1:157662/300‑1 (MQ=255) ttCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTACTTATctgc < 2:522914/300‑1 (MQ=255) agccATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTACTTATctgc < 2:5954/298‑1 (MQ=255) tCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAAACACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTCCAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCAGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGgtagtagttgtagattcaa > 2:274802/1‑289 (MQ=255) ccATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTACTTATctgcct > 1:5954/1‑298 (MQ=255) 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gtaCTTATCTGCTGATGCGAGAAACACATTACAATGCGGGTATATTCGTTTGGGTGTTAATGTTTTCACGCCTGATTATAAAACACCGTTATAGTGATCCTTCTATTGTGCCACCGCCACCTGCCTGGCAAATGAAAGCGGCTTCGCTAATGCACATCATGCTTTATATAACCTTCCTTGCACTTCCTCTGCTGGGGATTGCTTTGATGGCTTACAGTGGANAATCGTGGAGTTTCCTTGGTTTCAATGTGTCTCCCTTTGTTACCCCAAACAGCGAAATTAAAGCACTGATAAAAAata > 1:547044/1‑300 (MQ=255) gtaCTTATCTGCTGATGCGAGAAACACATTACAATGCGGGTATATTCGTTTGGGTGTTAATGTTTTCACGCCTGATTATAAAACACCGTTATAGTGATCCTTCTATTGTGCCACCGCCACCTGCCTGGCAAATGAAAGCGGCTTCGCTAATGCACATCATGCTTTATATAACCTTCCTTGCACTTCCTCTGCTGGGGATTGCTTTGATGGCTTACAGTGGAAAATCGTGGAGTTTCCTTGGTTTCAATGTGTCTCCCTTTGTTACCCCAAACAGCGAAATTAAAGCACTGATAAGAAata > 1:192446/1‑300 (MQ=255) gtaCTTATCTGCTGATGCGAGAAACACATTACAATGCGGGTATATTCGTTTGGGTGTTAATGTTTTCACGCCTGATTATAAAACACCGTTATAGTGATCCTTCTATTGTGCCACCGCCACCTGCCTGGCAAATGAAAGCGGCTTCGCTAATGCACATCATGCTTTATATAACCTTCCTTGCACTTCCTCTGCTGGGGATTGCTTTGATGGCTTACAGTGGAAAATCGTGGAGTTTCCTTGGTTTCAATGTGTCTCCCTTTGTTACCCCAAACAGCGAAATTAAAGCACTGATAAAAAata > 1:191818/1‑300 (MQ=255) | AATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACGCTGCTTTTCGTTGCAATAACCTATGCCGCGATGGAACTCCGTGGCTGGTTTCCTAAAGGTAGTAGTACTTATCTGCTGATGCGAGAAACACATTACAATGCGGGTATATTCGTTTGGGTGTTAATGTTTTCACGCCTGATTATAAAACACCGTTATAGTGATCCTTCTATTGTGCCACCGCCACCTGCCTGGCAAATGAAAGCGGCTTCGCTAATGCACATCATGCTTTATATAACCTTCCTTGCACTTCCTCTGCTGGGGATTGCTTTGATGGCTTACAGTGGAAAATCGTGGAGTTTCCTTGGTTTCAATGTGTCTCCCTTTGTTACCCCAAACAGCGAAATTAAAGCACTGATAAAAAATA > NC_000913/2042180‑2042776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |