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| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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CTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGA > NC_000913/4343464‑4344060 | acacCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCTCTGGTTCCt > 1:610007‑M1/1‑298 (MQ=255) 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CTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGA > NC_000913/4343464‑4344060 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |