| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,262,484 | IS5 (+) +4 bp | coding (1174‑1177/1209 nt) | tdcD ← | propionate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 159 (1.740) | 83/588 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3262484 = | 0 (0.000) | coding (1177/1209 nt) | tdcD | propionate kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 130 (1.420) | 69/590 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3262487 | 0 (0.000) | coding (1174/1209 nt) | tdcD | propionate kinase | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289821‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCATCCGTATCGAAAATGCAACCCACGCGCCGGTT < NC_000913/3262487‑3262191 GCCATCGCTCAGTTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATTACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGC < 2:96709/299‑1 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tccCATATCAGAGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAANCATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGGAAAAGTAATGGAAGGCATCCGT > 2:594084/4‑300 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCATCCGT > 2:730494/1‑300 TTGTTCGCACCTTCCTTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCtgtctcttatacacatctcgg < 1:348937/300‑22 CGCACCTTCCTTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCATCCGTATCGAAAATGCAACCCACGC > 1:523572/1‑300 ACCTTCCTTATGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTTAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACGGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAGTCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCATCCGTATCGAAAATGCAACCCACGCGC < 2:43054/299‑1 ACCTTCCTTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCATCCGTATCGAAAATGCAACCCACGCGC < 1:402997/299‑1 GCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289821‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGGCAAAGTTAACGCGCCCGCAGAATTTGCATAATTTAGTTGAAGTATTGTAGAGAGATTATTTTTCATGAAGGTAGATATTGATACCAGCGATAAGCTGTACGCCGACGCATGGCTTGGCTTTAAAGGTACGGACTGGAAAAACGAAATTAATGTCCGCGATTTTATTCAACATAACTATACACCGTATGAAGGCGATGAATCTTTCCTCGCCGAAGCGACGCCTGCCACCACGGAATTGTGGGAAAAAGTAATGGAAGGCATCCGTATCGAAAATGCAACCCACGCGCCGGTT < NC_000913/3262487‑3262191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |