| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1396019 = | NA (NA) | 669 (7.330) | 185/588 | 0.0 | 100% | intergenic (‑97/‑93) | ynaI/insH4 | small conductance mechanosensitive channel YnaI/IS5 family transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | = 1399593 | 0 (0.000) | intergenic (‑67/+128) | fnr/ogt | DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR/methylated‑DNA‑‑[protein]‑cysteine S‑methyltransferase | |||||
Only 100 of 669 total aligned reads displayed.
AATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1396316‑1396019‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATCAGCCAGCTTTGCATCCCGTTCACACTCAACGAACATGAGCTTGATCAGCTTGATAATATCATTGAGCGGAAGAAGCCTATTCAGAAAGGCCAGACGCTGTTTAAGGCTGGTGATGAACTTAAATCGCTTTATGCCATCCGCTCCGGTACGATTAAA < NC_000913/1399593‑1399296 TGCATGCAGTGAATGCTTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTTGGGTAAAACGGCTCGATGACTGCCACCATGTTTTGCTATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTTTCTGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCATGGACTTGTTCGCATCTTCCTTAGATAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGAC < 2:360167/299‑1 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GAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTATTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACTTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCT > 2:184189/1‑298 GCGTAGCATGGTTTCCNGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATNTTGCTACTTCCTTCCTTANACTTACTTGCTCCCTAA > 1:625976/1‑300 GCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCAACATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAA > 1:612342/1‑300 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TTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGACCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTGGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACTGCTTGAGCAGACC < 2:150012/299‑1 GGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCAACATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTAT > 1:364566/1‑299 GGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCTGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGA < 1:413231/300‑1 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TTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACNGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTC < 1:532347/300‑1 GGCAGGATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTATTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTAATGATGAACCATGTTCTATGGCTCAAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTCGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGACGCATTCAGT > 2:189661/1‑295 AATCTGCTCCATGCGGNACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATGGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGNAAAGCGAATTATACGGCGNATTCAGTCTGGCGGTT > 1:633142/1‑299 AATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCATACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTT > 1:589643/1‑299 AATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTT > 1:72962/1‑299 AATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCNGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCNTATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCAGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTT > 2:559532/1‑299 AATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATCCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGATACTTCCTTACTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCAGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGCCTGGCGGTT > 2:204511/1‑299 TGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGC < 1:474850/299‑1 GCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCAGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTA > 2:622423/1‑300 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ATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCC < 1:24497/298‑1 ATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTACTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCaat > 2:499415/1‑297 AAGAAAATTTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGTCGGTTGTGCTA < 2:306524/286‑1 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AATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAATGTTGCTACTTCCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1396316‑1396019‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATCAGCCAGCTTTGCATCCCGTTCACACTCAACGAACATGAGCTTGATCAGCTTGATAATATCATTGAGCGGAAGAAGCCTATTCAGAAAGGCCAGACGCTGTTTAAGGCTGGTGATGAACTTAAATCGCTTTATGCCATCCGCTCCGGTACGATTAAA < NC_000913/1399593‑1399296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |